骨质疏松症（osteoporosis，OP）是一种常见的老龄病，由于骨密度和骨质量下降、骨微结构破坏、骨脆性增加而易于发生骨折的全身性骨骼疾病，已经成为影响中老年人健康的重要的社会性问题。近年来，随着世界人口老龄化进程的加速，骨质疏松症的发病率也不断上升，给世界各国社会带来了压力，也给国家财政带来了负担。长链非编码RNAs（long noncoding RNAs，lncRNAs），是一类广泛存在于生物基因组中的的非编码RNA，转录本长于200nt.，其功能多样、作用机制复杂，在人类复杂疾病中遗传机制还需要进一步的研究。越来越多的研究表明lncRNAs在不同的细胞环境和各类疾病中扮演着重要的角色。本研究的目的是尝试鉴定与骨密度(Bone mineral density，BMD)相关的lncRNA基因多态性，并探索候选lncRNA位点潜在的生物学功能。　　本研究从lncRNASNP数据库中选择了55906个lncSNPs，用meta7样本作为发现样本(n=11140)，进行腰椎(SPN)、髋关节(HIP)和股骨颈(FNK)骨密度表型的全基因组关联研究(Genome-wide association study，GWAS)和整合meta分析，再在骨质疏松症协会公布的骨密度样本(GEFOS Sequencing，n=32965)中进行验证，尝试鉴定与骨质疏松症相关的lncRNA遗传多态性。然后，将鉴定的多态性位点进行Bonfferoni多重检验校正，显著性的阈值为P＜8.94×10-7。用RevMan绘制森林图，Haploview进行连锁不平衡关联分析。最后将通过统计检验得到的感兴趣的候选lncRNA多态性位点进行相关的功能预测。　　我们共鉴定了39个位于MEF2C-AS1(5q14.3)基因上的lncRNA单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism，SNP)位点与FNK-BMD表型相关，而且这39个SNPs都通过Bonfferoni检验校正，其中，最显著相关的SNP是rs6894139(P=3.03×10-9)，在GEFOS Sequencing中验证P值为1.43×10-23。连锁不平衡分析发现这39个SNP处于高度连锁不平衡状态(r2＞0.80)，一同位于MEF2C-AS1基因右侧的一个约55 kb的连锁不平衡区块中。另外，发现LOC100506136(7q21.3)与HIP-BMD关联，其中最显著的SNP是rs6465531(P=7.43×10-7)。　　研究结果表明MEF2C-AS1和LOC100506136可能在骨形成和骨质疏松症的发病中起重要作用，但是其作用机制还不是完全清楚。本研究首次利用GWASmeta分析发现MEF2C-AS1基因和LOC100506136基因与骨质疏松相关，为以后从分子生物学功能水平研究与骨质疏松的关系奠定了基础，为骨质疏松症的预防和治疗提供了潜在的靶点。