【摘 要】
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该论文应用线粒体12S rRNA基因全序列对中国鹿类动物的系统发育进行研究.实验共计完成中国鹿类14个物种21个个体的12S rRNA基因测序,获得16个单倍型,并报送GenBank(序列号:AY
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该论文应用线粒体12S rRNA基因全序列对中国鹿类动物的系统发育进行研究.实验共计完成中国鹿类14个物种21个个体的12S rRNA基因测序,获得16个单倍型,并报送GenBank(序列号:AY184425-AY184440).将上述序列与从GenBank检索到的獐、麂、水鹿、牛、马、羊、鼷鹿的12S rRNA基因全序列一起,通过应用分子系统学理论与模型分析序列数据,以及对12S rRNA二级结构的分析,得出了以下主要结论:(1)用最小进化方法(ME)和邻接法(NJ)对12S rRNA基因的全序列构建分子系统树的拓扑结构基本相同.(2)鹿科种内距离小于1﹪(0.1﹪-0.42﹪);鹿属内的物种间距离小于4﹪(1.29﹪-3.44﹪);鹿亚科内物种间距离为4.65﹪-8.86﹪;鹿科与牛科间的距离为11.75﹪-14.13﹪.(3)分子系统学结果支持狍从美洲鹿亚科转入獐亚科,并为其中的一个独立的属(狍属).(4)黑麝与马麝的12S rRNA基因序列完全相同,12S rRNA基因数据不支持黑麝与马麝为两个种.(5)该实验结果支持麝作为上科的分类阶元存在.(6)12S rRNA基因的碱基代换中转换数远远大于颠换数(2-20倍).(7)12S r RNA基因二级结构中,全序列核苷酸的碱基组成腺嘌呤(A)最多(平均为36.88﹪),鸟嘌呤最低(平均17.65﹪),与环区的碱基组成相类似.(8)环区的所有核苷酸碱基代换率为茎区的2.24倍,转换率几乎相同(0.051和0.082);而环区的颠换率却高达茎区的12.67倍.(9)得出了12Sr RNA基因的二级结构模型.(10)1000万年的12S rRNA基因的平均进化速率为(0.3418﹪±0.0390﹪)/位点·MY.
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