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肝细胞癌Hepatocellular carcinoma(HCC)是世界上最高危的恶性肿瘤之一,有非常差的预后和高致死率。近10年来,随着生物实验技术和计算机技术的不断发展,发现越来越多的分子标记物与HCC的预后密切关联,而这些标记物可能是揭开HCC预后差的关键因素。但是到目前为止,针对这些分子标记物还没有一个系统的研究,因此本课题建立了一个肝细胞癌预后分子标记物数据库(dbPHCC),可以对肝癌研究人员有所帮助。本研究主要专注于实验验证与HCC预后相关的分子标记物,相对高通量测序得出的数据,这些分子标记物信息会更加的准确,可靠。为此,本研究从文献出发,搜集了2002-2014年间在PubMed文献数据库中与HCC预后分子标记物相关的文章,从中筛选出预后分子标记物信息,并且对这些信息进行预处理,得到标准化的数据。而后,本研究以搜集到的信息为基础,整合现有公用数据库中的数据,利用生物统计学,生物信息学和计算机科学为研究人员提供方便的分析工具。通过文献搜索,本研究最终收集到了567个与HCC预后相关的分子标记物,主要包括3个水平的数据,其中蛋白质323个、mRNA 154个和90个miRNA。每个分子标记物主要包含了以下信息:文献信息、病人样本信息、分子标记物信息以及预后相关信息。结合这些信息和一些公用数据库的参考信息,本课题主要针对miRNA及其靶基因对HCC发生发展过程的影响,磷酸转移酶对HCC预后的影响以及预后分子标记物在HCC药物研发中能够起的作用进行了深入的研究。此外,为方便研究人员使用这些数据,本课题还提供网页查询和在线分析工具,dbPHCC工具的网址是:http://lifecenter.sgst.cn/dbphcc/。本研究的意义旨在为临床医生和HCC研究人员提供一个综合的查询分析平台,为药物新用和提高HCC病人预后生存期做出贡献。