广西棘蛙类的遗传多样性及棘蛙属种组间的系统发育关系

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棘蛙属属于两栖纲(Amphibian)、无尾目(Anura)、蛙科(Ranidae)。主要分布于亚洲东南部亚热带和热带地区,分布区东起我国沿海地区,西至阿富汉、巴基斯坦,南至越南、缅甸,北至喜马拉雅山和秦岭。棘蛙属目前在世界范围内共计29种,我国有21个种,占全部种的72.41%,其中7个为特有种,分布在秦岭以南的各省区,西起西藏、云南,东至闽浙,南至桂粤,但是海南和台湾没有分布。由于该属是蛙科系统关系研究的重要基础,所以它对于研究两栖动物的进化和地理分布等方面的研究都有着重大的价值。同时,作为脊椎动物进化中的过渡动物,在解剖、遗传、胚胎发育以及生物工程等方面也是较为理想的实验物种。过去对棘蛙的研究主要集中在形态分类、生理、胚胎、生化、细胞遗传等方面,很少涉及分子生物学和分子系统学的研究。本研究以广西棘蛙类为研究对象,应用PCR方法扩增线粒体12S rRNA基因、16S rRNA基因和Cytb基因的DNA片段,进行DNA序列测定,并运用ClustalX(1.83)、MEGA3.1、PAUP 4.0 b10和MrBayes3.0b4等软件对DNA序列数据进行处理分析;以费梁对棘蛙属种组的分组为基础,采用MrBayes3.0b4软件对所测得的12S rRNA和16S rRNA基因973bp的基因片段和从GeneBank下载的8种棘蛙的同源基因片段进行处理分析。目的在于:探讨广西棘蛙类种间和种内的分类地位和亲缘关系;研究广西棘蛙类的种组划分及丰富和完善棘蛙属不同种组间的亲缘关系,为研究棘蛙属的分子系统学奠定基础。应用MP法、ML法、NJ法和贝叶斯法(BI)对测定的棘蛙类的线粒体12S rRNA基因、16S rRNA基因和Cytb基因片段构建广西棘蛙类的系统发育树表明:不同方法对于同一基因片段所构建的树中,各支分类单元的组成相同,各支之间的关系也基本一致,说明所采用方法具有较好的可靠性;同一方法对不同基因片段所构建的树中,各支分类单元的组成相同,16S rRNA基因和Cytb基因片段各支之间的关系基本一致,12S rRNA基因片段则稍有些变化。结果表明:所研究的棘蛙类可分为3支:棘胸蛙类群;棘腹蛙类群;棘侧蛙类群。地理位置较近的同种棘蛙的亲缘关系也最近,这与两栖动物的运动迁移能力差相符合。应用贝叶斯法对我国棘蛙属11个种共32个样本的线粒体12S rRNA和16S rRNA基因973bp的基因序列构建的系统发育树,收集分子遗传信息。我们得出如下与传统分类学不同的结论:1.棘蛙属为一单系群。2.不支持棘肛蛙属和隆肛蛙属的划分。3.不支持将棘侧蛙划分到棘腹蛙种组中。4.推测小棘蛙和棘胸蛙是同一种棘蛙。
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