基因MTNR1Brs1387153及基因KTL14rs972283的变异位点与中国北方人群T2DM的相关研究

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yykk110
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2型糖尿病(type2diabetesmellitus,T2DM)是由多个基因与环境因子联合作用而引起的疾病,具有较强的遗传易感性。遗传因素参与T2DM的发生,与环境因素相互叠加,共同导致T2DM的发生。其中T2DM的遗传学研究,将为T2DM的早期识别、干预和个体化治疗提供全新的思路。本研究通过选择基因MTNR1B和基因KLT14上的2个SNP位点对2593例北方汉族人群进行病例-对照相关研究,寻找与T2DM相关的易感基因,探讨T2DM可能的遗传病因。   目的:探讨基因MTNR1Brs1387153及基因KLT14rs972283突变位点频率分布与中国北方地区人群的相关性。   对象及方法:研究对象:均来自卫生部北京医院承担的国家人类遗传资源库,从中选取得到2593例北方人群样本。包括北京地区人群:病例组共926例,男性598人,女性328人,平均年龄55.31±12.34岁。对照组共1006例,男性450人,女性556人,平均年龄52.14±10.23岁。大连地区人群:病例组共327例,男性187人,女性140人,年龄54.28±11.21岁;对照组共334例,男性241人,女性93人,年龄58.38±14.2岁。选取的病例组排除其他内分泌疾病,如肢端肥大症、甲状腺疾病、皮质醇增多症、结缔组织病等。对照组均来自健康志愿者。本次研究将北方汉族人群进行总体的病例对照相关分析。然后分别以北京地区、大连地区人群为研究对象,进行年龄、性别、BMI分组研究。研究方法:提取有核细胞基因组DNA,根据DNA序列设计引物,用多聚酶链反应技术(PCR)扩增含有rs1387153及rs972283所需的片段,再分别用Dde1、XSP1内切酶消化,以8%聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳分离酶切产物,检测酶切结果。分别比较病例组和对照组中各位点的频率分布,再分别以北京、大连两地区为研究对象,将病例-对照组按年龄、性别、BMI分为三组,研究基因MTNR1Brs1387153及基因KLF14rs972283的频率分布与北方人群以及北京、大连两地区人群的相关性。   结果:   1、MTNR1Brs1387153在北方人群中共检测出纯合型CC、杂合型CT、野生型TT三种基因型。在病例-对照组中频率分布分别为:18.8%、35.2%、46.0%;53.7%、6.7%、39.6%。x2分别为:2.24、2.31、2.20;OR值分别为:0.41、0.25、0.32;95%CI分别为:0.32~0.84、0.61~0.93、0.43~0.90,各组P值均大于0.05。MTNR1Brs1387153频率分布与北方人群无相关性。   2、KLF14rs972283在北方人群中共检测出纯合型AA、杂合型AG、野生型GG三种基因型。在病例-对照组中频率分布分别为:58.5%、4.5%、40.0%;56.4%、5.0%、38.6%。x2分别为:1.83、2.25、2.31;OR值分别为:0.35、0.27、0.33;95%CI分别为:0.26~0.94、0.28~0.90、0.33~0.85,各组P值均大于0.05。故KLF14rs972283频率分布与北方人群无相关性。   3、基因MTNR1Brs1387153将北京、大连地区人群中的病例、对照组的年龄分为≤40、40-60、>60三个亚组,检测出的CC、CT、TT三种基因在年龄分组中各亚组的频率分布分别为:北京地区:≤40年龄分组中病例组为:3.1%、7.7%、8.9%;对照组为:9.9%、20.3%、29.8%;x2为:2.21、2.45、2.56;OR值为:2.67、1.89、0.38;95%CI为:0.27~10.67、0.35~11.97、0.33~10.57;各组P值均大于0.05。40-60年龄分组中病例组为:8.0%、4.2%、27.6%;对照组为:6.1%、12.8%、13.6%;x2为:1.89、1.78、2.01;OR值分别为:0.78、1.65、0.44;95%CI分别为:0.29~09.97、0.30~11.87、0.28~09.85;各组P值均大于0.05。>60年龄分组中病例组为::8.1%、10.3%、22.1%;对照组为:1.5%、2.9%、3.1%;x2分别为:3.02、2.34、3.23;OR值分别为:2.76、2.53、2.43;95%CI分别为:0.35~11.75、0.37~08.77、0.25~09.45;各组P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153频率分布与北京地区人群年龄分组无相关性。   大连地区:≤40年龄分组中病例组为:2.4%、6.7%、8.9%;对照组基为:9.3%、5.7%、1.8%;x2为:2.13、1.79、2.31;OR值分别为:2.85、2.20、1.48;95%CI分别为:0.35~09.67、0.32~10.21、0.29~11.57;各组P值均大于0.05。40-60年龄分组中病例组为::3.4%、18.0%、15.9%;对照组为:18.3%、17.7%、3.3%;卡方值为:2.41、2.32、1.68;OR值为:2.17、2.61、0.48;95%CI为:0.59~10.91、0.42~12.60、0.28~09.97;各组P值均大于0.05。>60年龄分组中病例组为:1.6%、22.0%、21.1%;对照组为:22.6%、17.4%、3.9%;x2为:3.24、2.34、3.20;OR值为:2.76、2.10、2.42;95%CI为:0.55~08.97、0.34~09.05、0.45~07.45;各组P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153频率分布与大连地区人群年龄分组无相关性。   4、基因KLF14rs972283在北京、大连地区人群中的病例、对照组的年龄分为≤40、40-60、>60三个亚组,检测出的AA、AG、GG三种基因型在年龄分组中各亚组中频率分布分别为:北京地区:≤0年龄分组中病例组为:11.3%、1.1%、6.8%;对照组为:33.4%、2.9%、23.3%;x2为:1.89、2.68、2.56;OR值分别为:2.23、2.20、2.45;95%CI分别为:0.26~10.41、0.30~08.22、0.25~09.55;各组P值均大于0.05。40-60年龄分组中病例组为:24.3%、2.12%、19.2%;对照组为:12.7%、2.0%、11.4%;x2为:2.09、3.34、2.65;OR值为:2.17、2.61、0.48;95%CI为:0.47~08.96、0.44~11.50、0.56~12.56;各组P值均大于0.05。>60年龄分组中病例组为:21.6%、1.7%、11.9%;对照组为:3.9%、1.4%、3.7%;x2为:3.04、2.51、3.17;OR值为:2.76、2.10、2.42;95%CI为:0.39~07.57、0.44~10.27、0.38~09.44;各组P值均大于0.05。   大连地区:≤40年龄分组中病例组为:5.2%、30.9%、29.1%;对照组为:2.1%、24.8%、16.3%;x2为:2.53、1.58、2.21;OR值为:2.44、2.33、2.76;95%CI分别为:0.22~09.42、0.34~10.21、0.25~09.55;各组P值均大于0.05。40-60年龄分组中病例组为:0.6%、0.6%、2.4%;对照组为:2.1%、1.8%、1.2%;x2为:1.19、2.31、1.62;OR值分别为:2.09、1.78、2.46;95%CI分别为:0.41~08.91、0.32~10.12、0.28~07.52;各组P值均大于0.05。>60年龄分组中病例组为:2.4%、13.2%、15.6%;对照组为:22.8%、27.4%、1.5%;x2分别为:2.24、3.52、2.17;OR值分别为:2.06、2.09、2.27;95%CI分别为:0.30~08.47、0.38~10.09、0.40~11.45;各组P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153频率分布与北京、大连地区人群的年龄分组无相关性。   5、基因MTNR1Brs1387153在北京、大连地区人群中的病例、对照组按性别分为男、女两个亚组,检测出的CC、CT、TT三种基因型在性别分组中的频率分布分别为:北京地区:男性:病例组为:12.1%、23.0%、29.5%;对照组为:9.1%、15.1%、20.5%;x2为:1.98、2.04、3.21;OR值分别为:3.08、3.24、2.36;95%CI分别为:0.40~11.45、0.36~09.23、0.28~10.33;各组P值均大于0.05。女性:病例组为:7.1%、11.2%、17.1%;对照组为:9.3%、19.8%、26.2%;x2为:2.68、2.98、3.05;OR值分别为:2.76、2.58、3.14;95%CI分别为:0.58~09.63、0.29~10.34、0.38~12.34;各组P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153频率分布与北京地区人群的性别分组无相关性。   大连地区:男性:病例组为:8.9%、20.3%、28.3%;对照组为:14.7%、28.4%、29.0%;x2为:2.74、3.09、2.24;OR值分别为:3.08、3.29、3.24;95%CI分别为:0.23~10.45、0.36~09.23、0.28~08.33;各组P值均大于0.05。女性:病例组为:8.6%、17.4%、16.5%;对照组为:2.1%、9.6%、16.2%;x2为:2.26、2.88、3.15;OR值分别为:2.56、3.08、3.35;95%CI分别为:0.55~11.03、0.34~09.44、0.46~11.34;各组P值均大于0.05。基因MTNR1Brs1387153频率分布与大连地区人群的性别分组无相关性。   6、基因KLF14rs972283在北京、大连地区人群中的病例、对照组按性别分为男、女两个亚组,检测出的AA、AG、GG三种基因型在性别分组中频率分布分别为:男性:病例组为:36.7%、3.1%、23.4%;对照组为:26.2%、2.0%、17.4%;x2为:2.74、3.09、2.24;OR值分别为:3.08、3.29、3.24;95%CI分别为:0.23~10.45、0.36~09.23、0.24~08.33;各组P值均大于0.05。女性:病例组为:20.2%、2.1%、14.4%;对照组为:30.3%、4.0%、20.2%;x2为:2.26、2.88、3.15;OR值分别为:2.56、3.08、3.35;95%CI分别为:0.55~11.03、0.34~09.44、0.46~11.34;各组P值均大于0.05。基因KLF14rs972283频率分布与北京人群中的性别分组无相关性。   大连地区:男性:病例组为:35.2%、2.8%、20.8%;对照组为:40.7%、3.0%、27.2%;x2为:2.55、3.19、2.08;OR值分别为:3.12、2.29、3.09;95%CI分别为:0.32~09.45、0.42~11.23、0.34~09.31;各组P值均大于0.05。女性:病例组为:28.1%、0.9%、12.2%;对照组为:17.9%、0.9%、10.3%;x2为:2.76、2.19、3.24;OR值分别为:2.31、3.17、3.21;95%CI分别为:0.31~12.05、0.24~09.56、0.57~12.34;各组P值均大于0.05。基因KLF14rs972283频率分布与大连人群中的性别分组无相关性。   7、基因MTNR1Brs1387153将北京、大连地区人群中的病例组按BMI分为超重组BMI≥24,非超重组BMI<24两个亚组,检测出CC、CT、TT三种基因型在BMI分组中各亚组中的频率分布分别为:北京地区:超重组:16.6%、29.8%、40.2%;非超重组:2.6%、4.3%、6.5%;x2为:2.15、3.06、3.12;OR值分别为:3.11、2.98、3.33;95%CI分别为:0.35~10.36、0.27~11.22、0.28~10.36;各组P值均大于0.05。   大连地区:超重组:7.3%、4.9%、4.3%;非超重组:28.1%、33.6%、20.9%;x2为:2.20、3.16、3.02;OR值分别为:2.11、3.05、2.34;95%CI分别为:0.25~09.35、0.22~11.31、0.29~10.43;各组P值均大于0.05。故MTNR1Brs1387153频率分布与北京、大连地区中BMI分组之间无统计学差异。   8、基因KLF14rs972283将北京、大连地区人群中的病例组按BMI分为超重组BMI≥24,非超重组BMI<24两个亚组,检测出AA、AG、GG三种基因型在北京地区频率分布分别为:超重组:49.5%、4.1%、33.0%;非超重组:7.0%、1.5%、4.9%;x2为:2.24、3.07、3.14;OR值为:3.12、2.58、3.36;95%CI为:0.30~09.37、0.25~11.54、0.43~10.68;各组P值均大于0.05。基因KLF14rs972283频率分布与北京地区BMI各亚组之间无相关性。   大连地区:超重组:14.9%、13.5%、9.8%;非超重组:21.7%、24.5%、15.6%;x2为:2.35、3.04、3.22;OR值为:3.12、2.98、3.33;95%CI为:0.35~10.36、0.27~11.22、0.28~10.36;各组P值均大于0.05。基因KLF14rs972283频率分布与大连地区BMI各亚组之间无相关性。   结论:   1、MTNR1B基因内SNP138715C/T位点多态性与中国北方地区人群无相关性。以北京地区、大连地区两个研究对象分别进行年龄、性别、BMI分组研究,结果与北京、大连地区各分组均无相关性。   2、KLF14基因内SNP972283A/G位点多态性与中国北方地区人群无相关性。以北京地区、大连地区两个研究对象分别进行年龄、性别、BMI分组研究,结果与北京、大连地区各分组均无相关性。
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