农药在防治病、虫、草害方面的作用必不可少，而随着畜禽、水产养殖业的快速发展，兽药的种类和用量也日益增加。在生产和使用过程中，长期、大量使用的农药兽药通过各种途径进入水环境，从而引起水环境污染，直接或间接威胁着水生生态系统、饮用水安全和水产品安全，最终威胁到食物链顶端的人类的健康。　　本研究针对2014年7月饮用水源中的农药兽药残留在自来水厂水处理工艺环节中的浓度变化情况，分析研究饮用水源中农药兽药的复合污染状况。选择目标农药286种，目标兽药79种，分别以液-液萃取法(LLE)和固相萃取法(SPE)对目标物进行富集和净化，以GC-MS+LC-MSMS分组检测，替代物和内标物进行质量控制，方法具有较高的灵敏度和准确性。结果共检出农药种类157种，兽药种类21种。不同种类的污染物在水处理工艺环节中，削减程度有很大的差异。水样中检出农药总浓度分别为:进水口1419.31 ng·L-1、沉淀池624.52 ng·L-1、出水口492.96 ng·L-1，检出兽药总浓度分别为:进水口171.59 ng·L-1、沉淀池97.51ng·L-1、出水口31.74 ng·L-1，整体上来看，农药污染较兽药污染严重。根据检出结果，参照中国、美国、欧盟及世界卫生组织等的水质标准，对饮用水源中农药兽药的复合污染状况进行风险评价。在本研究调查的季节内，厦门饮用水是安全的。总体而言，饮用水源直接关系到人类的健康，农药兽药的复合污染导致的水质安全问题值得关注。