基于RNA-seq技术的BTH处理延缓香蕉后熟关键基因分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:moneymoneyoh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
BTH(苯并噻二唑,Benzothiadiazole)作为一种诱抗剂,可以诱导植物获得系统抗性,从而提高植物的抗病性。有研究发现BTH处理也可以延缓果实的成熟,但其延缓果实成熟衰老的相关机理研究报道较少。本试验以采后清水(对照)和杀菌剂(SP)两种处理为参照,研究BTH处理对香蕉果实后熟的影响及机理。采用的方法是基于转录组测序(RNA-seq)技术,通过比较三种处理及处理后不同时间点的香蕉果实转录水平基因表达的差异,筛选BTH处理延缓果实后熟的关键基因;重点分析香蕉后熟进程关键代谢途径中的差异基因表达趋势,以期揭示BTH延缓香蕉果实成熟的分子机理。差异基因表达研究主要包括以下代谢途径:与香蕉果实后熟软化有关的细胞壁代谢;与香蕉果实退绿转色相关的光合系统的稳定性维持;与香蕉果实衰老有关的活性氧代谢;与采后抗病性相关、次生代谢物质合成有关的苯丙烷代谢途径及激素信号途径,还有可能在其中起调控作用的WRKY、NAC、MYB转录因子。主要的研究结果如下:1.BTH处理明显延缓了香蕉果实的后熟进程,延缓了香蕉果实的转黄和软化进程,较好保持了果实的硬度,其有效延缓和抑制香蕉果实后熟过程中炭疽病的发生,提高了果实的耐贮性。2.BTH极大的诱导了香蕉果实中基因表达变化,从而诱导果实的抗性和延缓果实衰老,而杀菌剂处理对果实中基因表达影响极小,仅起到杀菌作用。测序结果共获得36425个Unigene,其中8206个是新基因。相对于采后0天果实,对照果实在果实后熟进程中共有10430个差异表达基因,说明有大量基因参与果实后熟进程。BTH处理与对照相比,共有4179个差异表达基因,其中2488个基因发生上调,1799个基因发生下调,在1、3、4天均发生变化的有139个差异显著的基因,其中137个基因显著上调,2个基因显著下调;杀菌剂处理和对照处理相比,共有70个差异表达基因,其中33个基因上调,37个基因下调,在不同处理天数有显著差异的基因,但是没有在所有天数都有显著差异的基因;BTH与杀菌剂处理相比,共有1533个差异表达基因,其中1029个基因上调,504个基因下调,在1、3、4天均发生变化的有86个显著差异基因,其中81个基因显著上调,5个基因显著下调。3.香蕉中TSS、TTS可变剪切所占比例比较高,分别约占所有可变剪切事件的33%、36%。而且BTH处理后这两类剪切的比例比另外两种处理均高1%左右。4.BTH处理后,香蕉果皮中与叶绿素合成相关的基因的表达量显著高于对照,与细胞壁降解相关的基因的表达明显受到抑制,与细胞壁降解相关的酶表现显著下调,香蕉果皮活性氧清除系统增强,包括POD、PPO、GRX(谷氧还蛋白)等相关基因的表达上调,苯丙烷途径中基因的表达增强,PR家族蛋白相关基因的表达被诱导,并且显著诱导了抗病基因类似序列(Resistance Gene Analog,RGA)的上调。推测BTH处理可以通过保持香蕉果实贮藏期间光系统、活性氧清除系统的稳定性,延缓细胞壁降解,增加次生代谢物质、抗病物质的积累,增强果实的抗逆性,延缓果实后熟进程,减少由于病害和衰老的相互促进作用引起的腐烂,从而延长了货架期。BTH处理还影响了激素信号途径中的PYL、ERF、SAUR、JMT等基因的表达,从而影响了果实正常的后熟进程,并提高了果实的抗性。5.通过GO分析可知,香蕉果皮在正常后熟过程中,差异基因在处理后第1d主要富集在光合系统、核苷酸代谢系统相关的GO term上;催熟后(第3d与第4d相比),差异基因显著集中在光合系统、呼吸系统、能量代谢系统、氧化还原等GO term上。而用BTH处理后,差异基因主要富集在系统获得抗性及其调节过程、系统的防御、免疫反应、脂肪酸、脂质生物合成与代谢、光系统I反应中心、类囊体、类囊体膜等GO term中;BTH处理与杀菌剂处理相比,差异基因除了富集在与系统获得性抗性、防御、免疫等功能相关的GO term上,还有富集在嘌呤核苷结合分子功能、氧化还原酶活性等GO term上。杀菌剂处理与对照处理的差异基因没有显著富集的GO term。6.通过KEGG分析可知,在香蕉果皮正常后熟过程中,差异基因在第1d主要富集在光合作用、乙醛酸和二羧酸代谢、糖酵解/糖异生、碳循环、碳固定、次级代谢产物的生物合成等通路上。差异基因在第3d主要富集在苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、笨丙氨酸代谢、次生代谢产物的生物合成等通路中。催熟后,即处理后第4d,差异基因显著富集在光合作用的天线蛋白、光合作用、氧化磷酸化、碳代谢、碳固定等通路上。BTH处理后,差异基因富集显著的通路有:泛醌等萜醌的合成、植物-病原菌相互作用、植物激素信号传导、苯丙素类的生物合成、苯丙氨酸的代谢途径、过氧化物酶体、脂肪酸的生物合成与延长、光合天线蛋白、光合作用等通路。BTH处理与杀菌剂处理相比,差异基因富集显著的通路有:泛醌等萜醌的合成、苯丙素类的生物合成、苯丙氨酸的代谢途径、植物病原菌相互作用、过氧化物酶体、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸的降解、谷胱甘肽的代谢等通路。杀菌剂处理与对照相比,因为本来差异基因数目就少,所富集的通路数目也少,且差异不显著。7.BTH处理显著提高了MYB家族和WRKY家族相关基因的表达,尤其是MYB4/6/8/86/108和WRKY40/41/60/63/67/70/71,而NAC家族基因部分上调,部分下调。MYB家族与次生代谢密切相关,而WRKY家族转录因子多于植物抗病性相关。表明BTH主要通过增强香蕉果皮的生物与非生物胁迫抗性,减少果实后熟衰老进程中病害的发生,延缓了果实的后熟进程。
其他文献
单细胞转录组测序技术的兴起,将人们的研究聚焦于一个细致的精度——细胞。所属不同类型的细胞构成了人体组织的异质性,而单细胞转录组测序数据从基因表达的水平帮助我们理解
红树林湿地处于潮汐周期性淹水的厌氧环境,被认为是大气二氧化碳(CO2)和甲烷(CH4)的主要排放源之一,但目前对于红树林湿地排放通量的高低及其对温室效应的贡献存在很大的争议。在
百度金融云面向银行、保险及互联网金融等行业,为其提供人工智能和百度生态支持等整体产品定制方案,为金融行业的生产效率提升以及业务创新提供可靠安全的技术支撑。车险智能定价管理系统为车险部门提供了一整套科学完善的核保辅助定价管理工具,利用“大数据”来多维度实现车险的差异化定价,使风险和保费匹配得更加科学合理。本系统主要包括经营目标管理模块、智能定价模块、业务分析模块、定价策略输出模块、定价回溯模块五大模
荔枝起源于我国,是最具特色和优势的南方水果,具有重要的经济和营养价值。但其果实在生长发育过程中恰值南方梅雨季节,导致严重的生理落果和经济损失,这是荔枝产业中亟需解决
离心喷嘴常被用作海水淡化横管降膜蒸发装置的布液设备,它的喷淋均匀性将直接影响到液滴在管束间成膜后的受热特性,进而决定了整套蒸发装置的热效率及稳定性。本文对顶部带有
车辆的行驶安全一直是汽车领域的重点研究问题。汽车主动安全技术随着科技的发展不断取得新的研究成果,从完全的人工驾驶,到各种辅助驾驶系统的加入,再到自动驾驶的实现,表明了汽车主动安全技术的应用对汽车领域的发展越来越重要。车辆稳定性控制是汽车主动安全技术发展过程中的重要成果,为车辆的安全运行提供了非常重要的保障作用。电子稳定控制系统(ESC)作为车辆装配的主动安全系统使车辆运行的稳定性有了显著的提高,有
近年来,根据海事部门治理内河船违法参与海上运输实际工作经验,对该现象存在的主要问题、问题的根本原因和问题产生的背景进行了全面分析,结合当前全面推进建设法治国家、法治政府,实现公正执法、严格执法、全民守法的良好氛围。探索海事执法的基本情况和海事监管的现状。随着经济、社会的迅猛发展,环渤海经济圈发展迅速。周边区域大量涉海和陆域建筑工程对建筑砂石料需求量剧增,在巨大经济利益的驱使下,地方部分企业或个人与
纳米技术的应用使越来越多的科学家将纺织品与纳米材料相结合,以形成在传统纺织品的基础上更加优良的性能,赋予纺织品更多新功能。但是由于缺乏很强的附着力,负载在织物表面
研究背景:口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是口腔内最常见的恶性肿瘤,其发生发展与包括紫外线照射、吸烟、酗酒、咀嚼槟榔、病毒感染等多方面刺激因素均有关联。OSCC具有侵袭性强,治疗后易复发的特点,虽然近年来在手术治疗配合放疗、化疗、中医中药等多种治疗手段的联合应用下预后有所改善,但综合来看患者的五年生存率仍不乐观。抗菌肽(antimicrobial
蚊蝎蛉科Bittacidae是长翅目Mecoptera昆虫中的重要孑遗类群,世界性分布,现生20属200余种。蚊蝎蛉成虫具有三对捕捉足,前足悬挂于叶片或树枝边缘,形似大蚊,因此得名“蚊蝎岭