47例胃癌及疑似组织的基因表达谱分析

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目的:识别胃镜下采集的胃癌及疑似组织与正常胃粘膜,以及胃癌与非胃癌组织的基因表达差异,进而理解胃癌的发病机制,探索临床分子分型指标,为个体化医疗提供基础资料。方法: 47份胃癌疑似病例行内窥镜检查取样活检,经病理学诊断确诊为28例胃癌和19例非癌炎症或其它病变胃部疾患。留取病变及对侧非病变胃粘膜上皮的组织,采用含14592个点的cDNA表达谱芯片建立胃癌及疑似组织的基因表达谱。差异表达基因筛选,以80%样本中有检测信号为标准,应用系统聚类、SAM方法作样本和/或基因表达相似性分析。实时定量RT-PCR方法验证芯片结果。结果:胃癌组筛选出262个差异表达基因,其中29个基因在胃癌组和非胃癌组有明显差异表达。聚类分析与消化和免疫功能、代谢水平相关的基因在各组内不同样本的表达谱型多样。实时定量RT-PCR验证结果与芯片一致。结论:建立胃镜标本的基因表达谱的分子分型有助于未来临床分子病理学的辅助诊断。胃癌组筛选了一批基因与非胃癌有表达差异,可作为胃癌的候选标志物。胃癌和非胃癌组,分别可以通过差异基因基因表达谱将其分为两型。
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