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大豆原产我国，是我国主要的经济作物之一。大豆属于喜磷作物，在整个生育期间需要较多的磷，我国南方红壤由于有效磷缺乏，产量大受影响。近年来，分子标记技术的出现及发展促进了大豆遗传作图的发展和农艺性状的QTL定位，进行分子标记辅助选择，培育高磷效率的新品种，使其适应低磷土壤环境，将成为一个重要的品种改良途径。本研究用以高磷效率品种巴西10号(BXIO)和低磷效率品种本地2号(BD2)为亲本构建的F2代分离群体，分别在田间条件和水培条件下种植，考查与磷效率相关的若干生物学性状，构建了基于微卫星分子标记(microsatellitemarkers，orsimplesequencerepeats，SSR)的遗传连锁图谱，并对磷效率相关性状进行了图谱定位，为分子标记辅助选择(Molecularmarker-assistedselection，MAS)在大豆高磷效率新品种选育中的应用打下基础。
本研究主要取得如下结果：
1．在已有的研究基础上，从已发表的大豆SSR引物数据库中选择合成了191对并进行了亲本多态性筛选，筛出呈共显性的引物77对，占40．3％，且筛选出的SSR引物遵循孟德尔遗传，信息量丰富，在亲本间具有高共显性和高多态性。
2．应用杂交获得的含104个单株的F2代分离群体，构建了一张包括20个连锁群，覆盖大豆基因组长度1647．3cM，包含187个SSR分子标记的遗传连锁图谱。该图谱的20个连锁群对应于公共图谱中的20个连锁群；其中，有12个连锁群的部分区段因找不到合适的标记，无法建立连锁关系而分成了几个小亚群。
3．田间试验中考查了与磷效率相关的包括地上部(叶片数、干重)、根部(根干重、根宽、根深、细根总根长、细根根表面积、粗根总根长、粗根根表面积、粗根根体积)和全磷含量(地上部全磷含量、根部全磷含量)共12个数量性状。12个性状表型值在两亲本之间均具有显著差异，在F2群体中的分离符合正态分布。用SSR对这12个数量性状进行了初步定位，均检测到QTL座位的存在，共检测出相关座位28个，其中的9个座位中的每一个均与3—8个性状相关。与根部全磷含量相关的2个座位定在连锁群F上的标记Satt146附近和Satt343，Satt586附近。细根总根长、细根根表面积、粗根总根长、粗根根表面积和粗根根体积等5个性状相关座位区域基本一致，分布在A2、Dla、G和M等连锁群上，特别是M连锁群的Satt702，对细根总根长、细根根表面积、粗根总根长3个性状的贡献率均大于15％，充分说明了这些性状之间是相互关联的，可作为磷效率性状评价指标。
4．水培试验中考查了与磷效率相关的包括地上部、根部和全磷含量性状等共12个数量性状，其中地上部性状和全磷含量性状在两亲本之间差异均不大，根部性状在两亲本之间有差异，在F2群体中的分离基本符合正态分布。对根部的6个性状进行QTL分析，6个性状均检测到QTL座位的存在，其中总根长、根表面积、根体积三个性状定位区域基本一致，分布在C2、N和O连锁群上，表明此条件下的根部性状能为磷效率性状评价提供一定的信息。比较田间试验和水培试验根部性状的QTL分布发现，二者结果大多不同，可能是由于田间低磷条件下磷效率主要表现为磷吸收效率，而水培条件下磷效率主要表现为磷利用效率之故。