青稞是青藏高原最具特色的农作物,是青藏高原极端环境条件下植物适应性进化的典型代表。早熟是青藏高原热量条件差、积温不足的高寒农区青稞充分利用热量资源,获得稳产、高产的重要途径;淀粉的成分构成是青稞的一项重要的品质指标,直接关系到青稞酿造与食品加工的最终用途。本研究开展了与青稞早熟具有高度相关性的早抽穗性状的遗传分析和直链淀粉含量的分子标记鉴定,主要结论如下:1.以青稞品种“达章紫”和“昆仑10号”及其经有性杂交形成的F₂和F_2:3群体为实验材料,使用主基因+多基因模型,解析了青稞早抽穗性状的遗传特征。青稞F₂群体的出苗至抽穗天数性状受2对加性-显性-上位性主基因影响,F_2:3群体在青海西宁和青海海北环境下早熟性状分别受1对加性-显性主基因和2对等加性-等显性主基因调控。同时发现在F₂群体中控制早熟性状的2对主基因的加性效应为负,即促进青稞植株早熟,而两个环境下控制F_2:3群体早熟性状的主基因均起推迟青稞植株抽穗的作用。同时发现除F_2:3群体在海北环境外,其余环境下基因型对表型的影响小于环境对表型的影响,相关研究结果有助于青稞早熟相关性状的选育。2.为了更好解析青稞的早熟遗传特征,以青稞品种“达章紫”和“昆仑10号”及其经有性杂交形成的F₂和F_2:3群体为实验材料,利用简化基因组测序技术对群体进行SNP标记的开发,利用生物信息学软件对SNP标记进行bin标记整合。利用Joinmap软件构建了F₂群体的高密度遗传图谱,该遗传图谱包含1,243个bin标记（包括2,380个SNP标记）,总长度为854.929 cM,平均两个标记间的遗传距离为0.69 cM,形成7个连锁群,进一步将7个连锁群定位在青稞的7条染色体上。在不考虑QTL和环境之间的互作关系时,F₂群体和F_2:3群体在三个环境条件下发现11个加显性QTL和8对上位性QTL,位于1H染色体上的qDfEH-1H-3在3个环境下均被检测到,推测木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶编码基因是该QTL区域的候选基因。在考虑QTL和环境之间存在互作关系时,F_2:3群体在2个环境中共发现9个加性QTL和15对上位性QTL,且上位性QTL主要以显性与显性互作为主。3.以简化基因组测序形成的GBS-SNP分子标记结合群分离法寻找在青稞品种“昆仑12号”与“糯青稞”杂交形成的F₂群体中调控青稞籽粒直链淀粉变化的相关的遗传位点。根据两亲本的遗传特点,共开发出22,506个具有多态性分子标记用于相关位点的关联分析,结合ΔSNP_index法并进行相关的拟合回归分析,将群体中调控籽粒直链淀粉含量的主效基因定位在7H染色体32.35 Mb的区域中。以直链淀粉含量差别较大的51份青稞材料为模板,利用引物SSR引物P₄进行扩增,随着参试材料直链淀粉含量的增大,其扩增产物的分子量也呈同步增大的趋势,Wx基因位点表现出多态性,二者呈正相关,该引物可作为糯性青稞品种选育的辅助选择标记。