水稻出饭特性的QTL分析和胶稠度qGC-10的精细定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yaozi303
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中国是世界稻作生产上首先利用杂种优势的国家。两系超级稻品种“两优培九”作为生产上成功推广的范例,是研究水稻产量、品质等遗传调控机理的优良亲本材料。本实验利用两优培九衍生的重组自交群体,考察亲本与群体饭粒型、米粒膨胀率、米粒延伸指数等15个与稻米出饭特性相关的指标,同时对RIL群体中籽粒胶稠度做了QTL分析,实验结果列于下:1.根据“两优培九” RILs重测序信息和2622个高质量SNP标记,构建了高密度SNP图谱,共覆盖基因组1381.9cM,平均图距0.392cM;2.利用QTL分析软件Mapping Version1.0,检测了粒长、粒宽、粒型、米粒浸泡后粒长、浸泡后粒宽、浸泡后粒型、饭粒长、饭粒宽、饭粒型、粒长膨胀率、粒宽膨胀率、米饭籽粒浸水膨胀率、米饭长延伸指数、米饭宽延伸指数、米饭延伸指数15个出饭特性指标,共定位到23个与出饭特性相关的QTLs;3.出饭特性QTLs分布在水稻的第1、2、4、5、6、7、8、9和11号染色体上。其中,在7号染色体SNP7-177和SNP7-121之间,约6.9cM的区间内,检测到一个同时控制米粒长和饭粒长的主效QTLqGL7;在6号染色体顶端检测到一个控制米饭多项出饭特性指标的QTL热点区域,该区间包含控制直链淀粉合成的主效基因Wx;4.RT-PCR实验表明,93-11和PA64s在不同灌浆时期,Wx的表达量差异明显,即Wx在93-11中的表达量明显低于PA64s,但表达模式基本一致,即灌浆初期,Wx基因表达量逐渐升高,在开花12天左右,Wx表达量达到最大,之后,表达量逐渐降低;5.RIL群体中共检测到3个对水稻籽粒胶稠度有调控作用的QTL位点,分布在水稻第5号、6号、10号染色体上。其中qGC-6、qGC-10在海南、杭州两地均检测到,贡献率10%以上,被认为是定位到的两个控制籽粒胶稠度的主效QTL位点;6.利用高密度SNP图谱,结合胶稠度表型值,从F7群体中筛选出qGC-10区间基因型单杂或双杂型的目标株系(F7-5、F7-23、F7-28),在海南试验基地和杭州试验田两地分别各与培矮64S回交2代和1代,构建完成回交自交群体BC3F2;7.在qGC-10目标区间内增设多对分子标记,对qGC-10目标区间进行精细定位,最终将qGC-10精细定位在Indel标记GC19和GC25之间约350kb的区间内。
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