NLRP3基因多态性与慢性胃炎、胃腺癌的遗传易感性研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:free522
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目的:探讨NLRP3(NLR family pyrin domain containing3或Nod-like receptor protein3)基因位点rs3806265、rs4612666和rs10754558单核苷酸多态性(SNP)与HP(Helicobacter pylori)感染、慢性胃炎、胃腺癌遗传易感性的关系。  方法:收集胃腺癌患者124例、慢性胃炎患者153例和健康体检者119例,其中HP阳性106例、HP阴性162例。采用AxyPrep试剂盒法对各组全血样本DNA提取,PCR扩增后,采用SNapshot测序技术对各组患者的NLRP3基因的3个SNP位点的等位基因和基因型进行检测分析。采用SPSS23.0进行卡方检验分析各基因型和等位基因频率在各组分布之间的差异。通过在线软件SHEsis构建NLRP3基因rs3806265、rs4612666和rs10754558三个SNP位点与Hp感染、慢性胃炎和胃腺癌的遗传易患性相关的单倍体。  结果:rs3806265的C和T两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P>0.05)。C和T两种碱基在健康对照组的分布频率分别为38.2%和61.8%;其在慢性胃炎组中的分布频率分别为38.2%和61.8%;其在胃腺癌组中的分布频率分别为39.1%和60.9%,三组间两两比较无统计差异(P>0.05)。rs3806265三种基因型CC、CT和TT,在健康对照组和胃腺癌组中仅出现CT和TT两种基因型。在健康对照组中,CT基因型分布频率为76.5%,而TT基因型分布频率为23.5%;胃腺癌组中,CT基因型分布频率为78.2%,而TT基因型分布频率为21.8%。而在慢性胃炎组中,CC基因型分布频率为5.2%(仅发现于慢性胃炎组,且全部为HP阳性),CT基因型分布频率为66.0%,而TT基因型分布频率则为28.8%。胃腺癌组与健康对照组相比基因型分布频率无统计学差异(P>0.05)。但慢性胃炎组与其余两组相比,基因型频率分布有统计学差异(P<0.05)。  rs4612666存在C和T两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P>0.05)。C和T两种碱基在健康对照组的分布频率分别为50.0%和50.0%;其在慢性胃炎组中的分布频率分别为55.2%和44.8%;其在胃腺癌组中的分布频率分别为39.1%和60.9%。慢性胃炎组与健康对照组的等位基因频率比较无统计差异(P>0.05)。胃腺癌组与健康对照组和慢性胃炎组比较,等位基因频率存在统计学差异(P<0.05)。三种基因型CT、TT和CC,在健康对照组中,CT基因型分布频率为28.6%,TT基因型分布频率为42.9%,而CC基因型分布频率为28.6%;在慢性胃炎组中,CT基因型分布频率为34.0%,TT基因型分布频率为42.5%,而CC基因型分布频率则为23.5%;胃腺癌组中,CT基因型分布频率为26.6%,TT基因型分布频率为51.6%,而CC基因型分布频率为21.8%。三组间NLRP3基因位点rs4612666基因型两两比较未出现统计学差异(P>0.05)。  rs10754558存在C和G两种碱基,在HP感染组与未感染组的比较中并未发现其等位基因频率和基因型与HP感染的相关性(P>0.05)。C和G两种碱基在健康对照组的分布频率分别为65.1%和34.9%;在慢性胃炎组中的分布频率分别为61.4%和38.6%;在胃腺癌组中的分布频率分别为64.5%和35.5%。三个研究组的NLRP3基因位点rs rs10754558等位基因频率构成比组间比较无统计学差异(P>0.05)。该位点存在CC、CG和GG三种基因型。在健康对照组中,CC基因型分布频率为43.7%,CG基因型分布频率为42.9%,而GG基因型分布频率为13.4%;在慢性胃炎组中,CC基因型分布频率为41.2%,CG基因型分布频率为40.5%,而GG基因型分布频率则为18.3%;胃腺癌组中,CC基因型分布频率为42.7%,CG基因型分布频率为43.5‰而GG基因型分布频率为13.7%。三个研究组的NLRP3基因位点rs10754558基因型CC、CG、GG构成比组间比较亦无统计学差异(P>0.05)。  NLRP3基因三个SNP位点rs3806265、rs4612666和rs10754558构建的单倍体与慢性胃炎和胃腺癌的遗传易感性无关;单倍体TCC、TTG可能是HP感染低风险单倍型(OR值分别为0.580[0.389~0.865]、0.034[0.003~0.374]),而TCG则是HP感染的高风险单倍型(OR值1.551[1.020~2.357])。  结论:NLRP3基因三个SNP位点rs3806265、rs4612666和rs10754558构建的单倍体TCC、TTG可能是HP感染低风险单倍型,而TCG则可能是HP感染的高风险单倍型。rs3806265、rs4612666和rs10754558等位基因频率与HP感染、慢性胃炎遗传易患性无关。rs4612666和rs10754558基因型与HP感染、慢性胃炎遗传易患性无关。NLRP3基因位点rs3806265基因型CC只出现在慢性胃炎中,提示该基因型属于慢性胃炎的易患因素。rs3806265和rs10754558等位基因频率与胃腺癌遗传易患性无关。rs4612666等位基因频率与胃腺癌的遗传易感性相关,野生型碱基T频率较高更易患胃腺癌。rs3806265、rs4612666和rs10754558基因型与胃腺癌的遗传易患性无关。
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