SSB蛋白的克隆、表达和功能研究

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单链结合蛋白(Single-Stranded DNA-Binding Protein,SSB)在DNA复制、重组和修复中起着重要作用。为阐明单链结合蛋白SSB的体外生物功能,本研究构建了融合蛋白SSB的表达载体并使其高效表达并易于纯化。ssb基因片段是以E.coli K-12基因组为模板经PCR扩增获得,通过基因的体外拼接,成功构建了表达载体pQE30-ssb。重组菌株M15/pQE30-ssb经过IPTG的诱导表达了SSB蛋白;收集菌体细胞,经超声波破碎后离心,取上清进行SDS-PAGE分析,得到了一条与预期分子量(19.5 kD)相应的诱导表达条带,其表达量约占全细胞蛋白的30%且以可溶形式存在。 利用固定化金属离子(Ni<2+>)配体亲和层析柱和凝胶过滤层析等方法纯化融合蛋白SSB,其纯度达到90%。利用表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)技术对SSB蛋白的生物功能进行了系统研究。结果表明:SSB蛋白以四聚体形式与单链DNA分子结合;在有无镁离子的情况下,两者的平衡解离常数(equilibrium dissociation constant,K<,D>)分别为4.79x10<-7>M和9.67x10<-7>M;阐明了镁离子对于两者作用形式的影响。利用原子力显微镜(Atomic Force Microscopy,AFM)技术在单分子水平分别观察SSB蛋白、ssDNA和SSB-ssDNA复合物的成像,SSB蛋白分子通过协同作用于底物ssDNA并能非特异性结合在ssDNA上,此发现为下一步研究SSB在DNA代谢中作用模式的单分子可视化研究奠定了基础。
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