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目的:探讨2015年重庆地区手足口病的流行病学、病原谱分布特点及其分子生物学特征,为该地区手足口病的疫苗研制和预防及控制奠定基础.方法:采用描述性流行病学方法对2015年重庆市儿童医院接诊的手足口病病例进行统计学分析;同时采用巢氏RT-PCR方法对收集到的242例住院患儿的粪便标本进行扩增和测序,构建系统进化树,分析本地区手足口病病原的基因进化特征。结果:1.对2015年重庆医科大学附属儿童医院全年共接诊的13854例手足口病病例研究分析,结果显示,手足口病存在两个发病高峰季节,分别为4-7月和10-12月,以前者为主,分别占全年发病总数的57.47%和30.81%;男性多于女性,发病的性别比例为1.49:1,5岁以下患儿占全部发病人数的97%,好发人群以散居及幼托为主(占全部病例总数的(97.99%)。2.2 42例手足口病住院病例的粪便标本中,检出肠道病毒感染210例(阳性率为86.78%),其中EV71占58.10%(122/210)、CA16占2.38%(5/210)、CA6占2.86%(6/210)、其他肠道病毒占26.67%(56/210)以及混合感染占10%(21/210),无单独的CA10感染病例。21例混合感染中EV71和CA16、EV71和CA6、EV71和CA10同时感染分别有1、19、1例,所占百分比分别为0.48%(1/210)、9.05%(19/210)、0.48%(1/210)。各病原型中混合感染所占的比例:ev71为14.69%(21/143)、ca16为16.67%(1/6)、ca6为76.00%(19/25)、ca10为100%(1/1)。2015年全年均以ev71感染为主,其中4-7月ev71感染比例最高,而10-12月柯萨奇病毒(主要是ca6)的感染例数则较4-7月份明显升高,但仍低于ev71。不同临床类型中,均有ev71感染病例发生;重症病例中ev71仍是优势病原菌,而普通病例则是以ev71、柯萨奇及其他肠道病毒共同流行所致。各年龄组中均有ev71感染,2岁以内随着年龄增加,ev71的感染例数逐渐增多,2岁组最高,2岁以后随年龄增加感染例数逐渐减少;而柯萨奇病毒、其他肠道病毒及混合感染随着年龄增长发病率呈下降趋势。3.病原的基因序列分析结果显示,2015年重庆地区ev71流行株属于c4a亚型;ca16流行株属于b1b亚型;ca6与2013-2014年英国及中国内地等的代表株同源性较高;ca10具有地域分布特征,与近年来我国内地其他地区的分离株进化距离较近,属于同一传播链。结论:2015年重庆地区的手足口病具有明显的季节分布特点,性别及职业分布也有较大差异。2015年全年该地区存在两个发病高峰,但以4-7月为主,男性多于女性,发病人群以5岁以下的散居及幼托儿童为主。ev71为2015年重庆地区手足口病的主要病原菌,其他肠道病毒和柯萨奇病毒则交替成为第二位主要病原体;混合感染在ca6和ca10中所占比例较大。手足口病的病原构成在不同季节及临床类型中的差异具有统计学意义,而在各年龄段及性别特征上上无明显差异。EV71在2岁以内随着年龄增加,发病例数逐渐增多,2岁组最高,2岁以后随年龄增加感染例数逐渐减少;而柯萨奇病毒、其他肠道病毒及混合感染随着年龄增长发病率呈下降趋势。2015年4-7月EV71感染比例最高,而10-12月柯萨奇病毒的感染例数则较4-7月份明显升高,但仍低于EV71。重症病例中EV71仍是优势病原菌,而普通病例则是以EV71、柯萨奇及其他肠道病毒共同流行所致。2015年重庆地区EV71分离株属于C4a亚型;CA16分离株为B1b亚型;CA6与2013-2014年英国及中国内地等的代表株同源性较高;CA10具有地域分布特征,与近年来我国内地其他地区的分离株进化距离较近,属于同一传播链。