科学技术是第一生产力。当前我国经济发展的主题是“开展自主创新,促进科技发展,推进产业结构调整和转型升级,加速经济结构高级化进程”,要求各地依靠科技力量实现经济发展方式的转变。而财政科技投入是地方科技事业发展的基本保障,是提高地方综合竞争实力、促进经济发展、提高人民生活水平的重要战略方向,并且在科技活动中的作用是其它方式的科技投入不可替代的。地方财政科技投入绩效评估就是在这种背景下被引入的,尤其在我国的市场经济条件下,已成为公共支出管理的重要环节,和改善公共管理水平的重要工具,对于进一步优化财政科技资源配置、完善政府公共科技服务和深入科技投入管理体制改革有着重要的意义。本文在总结国内外实践经验与文献综述的基础上,以技术经济学理论、公共财政学理论、现代统计学的理论基础为指导,综合运用统计学、运筹学、系统学和数理统计学的研究方法,探索出一套可以为我国地方政府部门适用的、客观合理且操作性强的财政科技投入绩效评估的基本思路和技术方法,以促进在我国尽快建立和完善科学、规范、系统的财政支出绩效评估体系。在规范研究结合案例分析的基础上,本文的贡献和创新之处主要有以下四点:(1)总结了地方财政科技投入及其绩效评估的特点;(2)以现实状况和相关理论为基础,针对地方财政科技投入的绩效评估这项复杂且应用性很强的研究,分析了如何构建模型、筛选指标,设计一套地方财政科技投入绩效评估指标体系;(3)分别对基于项目层面和基于总体层面的财政科技投入绩效评估,分析推荐了较为科学合理、操作性强的评估方法;(4)以典型城市的案例研究为基础对构建的指标体系和选取的评估方法进行验证,为我国其他地方政府部门的科技投入绩效评估工作提供了可参考借鉴的分析工具。