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在本论文中,我们发现并证实了Arap3是Vav2的一个新的相互作用蛋白,Vav2是小GTP酶Rac的鸟苷酸交换因子(GEF),而Arap3是小GTP酶Arf6和RhoA的GTP酶激活蛋白(GAP)。我们发现Vav2的SH2结构域可以识别Arap3的两个酪氨酸磷酸化位点pY1403和pY1408,并进一步利用NMR手段解析了Vav2SH2结构域与小肽Arap3-pY1408复合物的溶液结构。此外,我们还对Arap3的ArfGAP结构域进行了初步的结构研究。第一章是关于Vav2和Arap3以及相关的小GTP酶的背景介绍。Vav2和Arap3都是细胞内重要的信号转导蛋白,都被发现在细胞的扁平伪足形成和细胞迁移过程中发挥关键的作用。第二章是关于Vav2与Arap3的相互作用研究以及Vav2SH2结构域与小肽Arap3-pY1408的复合物结构解析。我们首先发现并证明了Vav2与Arap3之间存在相互作用,它们之间的相互作用受到Arap3磷酸化水平的调节,突变Arap3上的两个酪氨酸磷酸化位点pY1403和pY1408严重减弱了Vav2与Arap3的结合。磷酸化位点pY1403所在的蛋白序列YEEP与已报道了Vav2SH2结构域的偏好性一致,而pY1408所在的蛋白序列YEEV,残基Val处在pY+3位置与已报道的Vav2SH2结构域的偏好性不同。根据我们的核磁滴定和ITC实验,小肽pY1403和pY1408与Vav2SH2结构域都具有较高的结合能力,解离常数(Kd)分别为～0.271μM和～1.40μM。通过对Vav2-SH2/小肽pY1408复合物的结构解析发现,Vav2-SH2结构域的pY+3疏水结合口袋比较浅,小肽pY+3位的Val残基的侧链与位于这个疏水口袋表面的残基存在大量的疏水相互作用。第三章是关于ArfGAP结构域的信息以及我们对Arap3的ArfGAP结构域的溶液结构研究。我们通过限制性酶解的方法选取了Arap3上的一个蛋白片段,这个片段包含整个ArfGAP结构域以及位于ArfGAP结构域C-端的约30个氨基酸残基大小的延伸区域。目前已经完成了化学位移认证工作,结构解析正在进行。