施用粪肥的设施菜地土壤中抗生素及抗性基因多样性及丰度的研究

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抗生素作为20世纪最重要的发现之一,在保障人类及动物健康以及促进畜禽养殖业发展方面起着不可替代的作用。然而,由于抗生素的误用和滥用,使得大量的抗生素以原药或代谢物的形式随人或动物体的排泄而进入环境,导致环境中,特别是土壤环境和水环境中存在大量抗生素残留,进而增加了土壤或水环境中微生物的抗性压力,加速了大量抗性微生物的产生。抗性微生物对抗生素产生耐药性的主要原因是其携带有各种抗生素抗性基因,因此,抗生素的大量使用直接或间接增加了环境中抗性基因的含量。设施菜地是使用畜禽粪便较为频繁的场所,因此,研究设施菜地土壤中抗生素含量、耐药菌数量以及抗性基因的含量是十分必要的。本研究采集了山东潍坊、泰安、滨州、东营四个地区长期使用粪肥的9个典型设施菜地土壤,研究了设施菜地土壤中抗生素及抗性基因含量等。本实验选取了四类抗生素进行实验,利用固相萃取(Solid Phase Extraction,SPE)以及高效液相色谱(High Performance Liquid Chromatography,HPLC)检测的方法,检测了土壤样品中三种抗生素的含量;另外,对土样中含有的可培养细菌进行了数量的统计及菌种的鉴定;选取了五类共12种抗性基因和可移动遗传元件(MGE)利用real-time qPCR定量检测的方法对其丰度进行了测定。最后,将抗性基因的含量与土样理化性质、抗生素含量、耐药菌的数量以及MGE的含量进行综合分析。该论文的主要研究结果如下:(1)在土壤样品抗生素含量检测实验中,强力霉素在所有土壤样品中均有检出,浓度范围在52.37μg/kg~428.16μg/kg之间;磺胺二甲嘧啶除了在土样S4中没有检出外,其他土样中均有检出,浓度范围在14.12μg/kg~81.31μg/kg之间;泰乐菌素只在S0、S2、S3、S4和S8这5个土壤样品中有检出,浓度范围为70.01μg/kg~482.36μg/kg。(2)在可培养抗生素耐药菌实验中,土样中的耐药菌对抗生素的耐药性因抗生素种类和浓度的不同而在数量上呈现出较大差异。在未使用过粪肥的土样S0中,细菌对抗生素仍有一定的抗性存在,长期使用粪肥的菜地土样S1~S9耐药率要高于土样S0。随着抗生素浓度的增加,细菌耐药率逐渐降低。土壤耐药菌对四种抗生素的耐药率大小依次为:磺胺二甲嘧啶>泰乐菌素>恩诺沙星>强力霉素。(3)在抗生素耐药菌分离鉴定实验中,共筛选出强力霉素耐药菌12个属,17个种,优势菌株为链霉菌属;筛选出磺胺二甲嘧啶耐药菌9个属,16个种,优势耐药菌为芽孢杆菌属;筛选出恩诺沙星耐药菌9个属,16个种,优势菌株为微杆菌属;筛选出泰乐菌素耐药菌9个属,12个种,优势菌株为寡养单胞菌属和假单胞菌属。芽孢杆菌属、金黄杆菌属和假单胞菌属属于多重耐药菌。(4)在选取的五类共16种抗性基因中,tet W、tetM、tetO、sul1、sul2、qepA、qnrB、qnrS、ermB、ermF的检出频率均为100%。在定量实验中,各种抗性基因在不同土样中的含量存在较大差异。四环素类抗性基因中,tetM的含量最高,磺胺类抗性基因中sul2的含量较高,喹诺酮类抗性基因中,qepA的含量相对较高,大环内酯类抗性基因中,ermF的含量相对较高。可移动元件intI1的含量相对较高。各抗性基因总量关系为:磺胺类>大环内酯类>四环素类>喹诺酮类。(5)从土样理化性质方面分析,土样pH值与恩诺沙星耐药菌数量之间呈现极显著相关,重金属含量与喹诺酮类抗性基因qnr呈现极显著相关;从抗生素含量角度分析,土样中强力霉素含量与泰乐菌素的含量及磺胺类抗性基因的含量sul呈现极显著相关,与强力霉素耐药菌及磺胺二甲嘧啶耐药菌呈现显著相关,泰乐菌素的含量与磺胺类抗性基因sul之间也呈现出极显著相关;从可移动元件角度分析,土样中可移动元件总量intI与磺胺类抗性基因sul及大环内酯类抗性基因erm呈现极显著相关。
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