青海地区藏、汉族胃癌差异表达基因的筛选研究

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目的:以青海地区藏族和汉族胃癌血浆、组织标本为研究对象,采用mi RNA芯片等相关检测方法,分析青海地区藏、汉族胃癌发生发展过程中的基因表达差异。方法:收集2017年10月-2019年03月在青海省人民医院行手术治疗胃癌患者胃癌、癌旁组织及术前静脉血各80例,同时收集健康者静脉血10例(其中藏族5例,汉族5例),并采集临床资料。从75例胃癌手术患者中随机选取5例藏族、5例汉族胃癌患者胃癌组织、术前血浆作为病例组进行mi RNA芯片检测,5例藏族、5例汉族健康者静脉血血浆为对照组进行mi RNA芯片检测,筛选出差异表达的mi RNA并通过相关软件预测差异mi RNA可能的靶基因,并对这些靶基因进行聚类分析、基因功能及信号通路分析。结果:1.通过基因芯片检测及进一步筛选得到了235个可能有意义的差异mi RNA,其中表达上调的118个,下调的117个(P<0.05且FC≥2)。2.通过12种数据库预测得到差异mi RNA可能的靶基因,以及靶基因可能的功能、靶基因可能富集到的一些信号通路。3.根据P值及FC值从每组筛选出10个差异mi RNA共40个差异mi RNA准备进行下一步验证。结论:1.采用mi RNA芯片技术获得了高原藏、汉族胃癌患者的血浆、组织mi RNA表达谱,初步筛选得到了40个可能有意义的差异mi RNA。2.胃癌患者与健康者之间mi RNA存在明显差异表达。3.藏族、汉族胃癌患者之间mi RNA存在明显差异表达。4.血浆、组织样本之间mi RNA的表达有差异。
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