论文部分内容阅读
Cav-1, 3基因同属于Caveolin基因家族,Cav-1蛋白有结合脂肪酸,影响脂肪沉积的功能,Cav-3蛋白对肌肉发生及其功能的维持起着重要作用。本研究通过RACE、实时荧光定量PCR和PCR-SSCP方法研究了肉鸭Cav-1, 3基因的结构特征、表达特征及其品种间多态性。主要研究结果如下:(1)首次克隆了鸭Cav-1, 3基因的全长cDNA序列(Accession No: HM054162, HM054163)。鸭Cav-1基因全长cDNA 2603 bp,该序列包含537个核苷酸的开放性阅读框,编码178个氨基酸。鸭Cav-3基因全长cDNA 1066 bp,此序列包含456个核苷酸的开放性阅读框,编码151个氨基酸。将获得的2个基因与其他家禽以及哺乳动物的序列进行比对,发现鸭Cav-1, 3基因与鸡的同源性最高,分别为95.16%、91.67%,与哺乳动物的同源性分别为83.0%、78.0%左右,基因的进化关系与动物形态分类学结果一致,揭示了这些基因在进化中的保守性及其对生理功能的重要性。(2)实时荧光定量PCR证实鸭Cav-1基因在所检测的12个组织中均有表达。其中在心肌中的表达量最高;胸肌、肺、腿肌和脂肪中度表达;肌胃、脑、肠和腺胃小量表达;肝脏、肾和脾微量表达。鸭Cav-3基因在心肌中表达量最高;胸肌、腿肌、肾脏中度表达;其他组织痕量表达。这些结果说明Cav-1, 3基因在动物各组织中起到了重要作用。(3)以金定鸭、巢湖鸭、樱桃谷鸭和高邮鸭四个品种为实验材料,利用PCR-SSCP方法对Cav-1, 3基因进行单核苷酸多态性研究。在鸭Cav-1基因序列中没有检测到突变。在Cav-3基因第2外显子上检测到A489G、G501A、A557G、T563A、A602G共5个单碱基突变,其中前2个突变在编码区,为同义突变,其余3个突变位于3′-UTR区。这使所检测的4个品种共呈现6种基因型。在Cav-3基因内含子上检测到C805T 1个碱基突变,这使所检测的4个品种共呈现3种基因型。群体遗传学分析发现,所检测到的多态位点基因型频率分布与品种相关联,樱桃谷鸭在所检测的4个品种中Cav-3基因的遗传变异程度最小。