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长江口水生态环境复杂,生物多样性丰富,近来年,长三角地区经济飞速发展,人类的活动对长江口生态环境的影响也越来越大,因此,长江口水域的生态问题的研究备受重视。本研究于2010年10月-2011年9月、2012年9月、12月、2013年3月和6月,对长江口浮游植物进行调查;于2012年3月、6月、9月和12月对长江口轮虫进行季度调查。通过长江口浮游植物和轮虫群落生态研究,阐明长江口浮游植物和轮虫生态特征,丰富长江口生态研究理论。主要研究结果如下:1.长江口浮游植物两周年调查共采集到浮游植物311种,隶属于8个门,其中以硅藻门种数最多,为219种,其次为绿藻门有34种,蓝藻门26种,裸藻门12种,甲藻门11种,黄藻门5种,金藻门和隐藻门各2种。在2010-2011年的周年调查中,共鉴定出浮游植物183种(包括变种和变型),隶属于7门60属,其中硅藻门种类最多,为137种;其次为绿藻门,有21种;蓝藻门14种,黄藻门和裸藻门各4种,甲藻门有2种,金藻门有1种。2012-2013年季度调查中,共采集到浮游植物231种(包括未定种),隶属于8门83属。硅藻门种类数最多,为161种;其次为绿藻门,有25种;蓝藻门有19种,甲藻门有11种,裸藻门有8种,黄藻门有3种,金藻门和隐藻门各2种。2.2010-2011年全年优势种为中肋骨条藻(Skeletonema costatum)和具槽直链藻(Melosira sulcata);各月的浮游植物优势种主要为硅藻,但3月水华微囊藻(Microcystis flosaquae)和两栖颤藻(Oscillatoria amphibia)成为了优势种,9月则出现大量了黄丝藻(Tribonema sp.),针晶蓝纤维藻镰刀型(Dactylococcopsis rhaphidioides var.lciformis)在2月、7月和10月成为优势种。在2012-2013年季度调查中,全年优势种为中肋骨条藻,各季节的优势种有一定的差异,秋季为中肋骨条藻、鳞孔藻未定种(Lepocinclis sp.)、羽纹藻未定种(Pinnularia sp.)、颤藻未定种(Oscillatoria sp.)和柔软舟形藻(Navicula mollis);冬季有中肋骨条藻和海洋菱形藻(Nitzschia marina);春季和夏季的优势种都仅有中肋骨条藻。3.2010-2011年长江口浮游植物全年密度在2.83×103-6.18×104cells/L之间,6月的密度最高,1月的密度最低,全年的平均密度为1.73×104cells/L。2012-2013年的季度调查中,浮游植物密度在3.26×105-8.22×105cells/L之间,平均密度为5.362×105cells/L,浮游植物密度的峰值出现在夏季,而最低值出现在秋季。4.2010-2011年浮游植物Pielou均匀度指数3月最低,1月的均匀度最高为0.85;丰富度指数全年变化幅度较大,在1.8-5.5之间,12月的丰富度指数最低,6月的丰富度指数最高;Shannon-Wiener指数在1.6-3.4之间,峰值出现在了2月,最低值出现在3月。2012年-2013年长江口浮游植物的Shannon-Wiener多样性指数为0.49-2.09,Margalef丰富度指数在3.79-5.80之间,Pielou均匀度指数为0.09-0.39;浮游植物的多样性指数季节变化明显,秋季长江口浮游植物各个多样性指数都为最高;冬季Margalef丰富度全年最低;从冬季开始,Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数发展趋势一致,随季节变化逐渐下降,在夏季达到全年最低值。5.CCA分析结果表明,2010-2011年长江口浮游植物可大致分为6个类群,中肋骨条藻,具槽直链藻,条纹小环藻(Cyclotella striata)和颗粒直链藻(Melosira granulata)所在的类群在该水域浮游植物群落中的优势地位明显,它们密度的变化极大的影响着整个群落的结构,这一类群与温度呈正相关,与浊度负相关;2012-2013年长江口浮游植物可分为4个大类群,中肋骨条藻、海洋菱形藻,这两个优势种与盐度和悬浮物呈正相关,而优势种鳞孔藻未定种、羽纹藻未定种则与盐度和悬浮物负相关;长江口浮游植物区系分布主要受到温度、悬浮物、盐度的限制。6.2012年长江口轮虫季度调查中,共采集到轮虫23种,隶属于8个科。其中臂尾轮科有10种,鼠轮科3种,疣毛轮科、镜轮科、腹尾轮科和腔轮科都为2种,椎轮科和晶囊轮科各1种。长江口水域轮虫种类数在秋季达到峰值,为15种;冬季为全年最低,为7种。7.本研究中,针簇多肢轮虫最为常见。春季轮虫有5个优势种,其中优势度最高的为长三肢轮虫(Filinia longiseta),优势度为0.33;夏季有7个优势种,针簇多肢轮虫(Polyarthra trigla)优势度最高,达到0.37;秋季有6个优势种,针簇多肢轮虫优势度为0.30,高于其他;冬季优势种较少,只有3种,螺形龟甲轮虫(Keratella cochlearis)的优势度较高,为0.26。8.长江口轮虫全年平均密度为108.33ind./L。密度最高出现在春季为231.33ind./L,此后轮虫密度随季节的更替逐渐降低,在秋季密度达到全年最低值,为35.33ind./L。9.长江口轮虫香浓威纳指数在0.98-2.50之间,均匀度指数在0.49-0.88之间,丰富度指数在0.53-0.94之间。长江口轮虫群落多样性指数呈现明显的季节变化,春季、夏季逐步上升,在秋季达到最高,冬季多样性指数跌至全年最低。10.通过对长江口浮游植物和轮虫群落的研究,发现浮游植物和轮虫群落都呈现季节性的变化,春夏之际是浮游植物和轮虫生长旺盛的时段,此外,温度、盐度和悬浮物是影响长江口水生生物的最重要环境因素。