青藏高原裂腹鱼亚科鱼类在适应高原环境的过程中，演化出了变异丰富真皮骨结构，其中体表鳞片的退化最为引人注目。已知成纤维生长因子受体1a(Fgfr1a)基因和外胚层发育不良蛋白A受体(Edar)基因的突变会引起斑马鱼的鳞片缺失，且Fgfr1a是鲤鱼在人工选择下的靶点。然而，这些基因是否参与自然选择下裂腹鱼的鳞片退化还不得而知。本研究基于已有线粒体基因组序列重建了裂腹鱼亚科鱼类的系统发育关系，并采用RT-PCR和克隆测序的方法获得了裂腹鱼亚科代表物种的Fgfr1a和Edar基因CDS序列，对序列进行了分子系统发育分析。　　本研究主要内容包括：⑴在鲤科鱼类的框架下重建了裂腹鱼亚科鱼类的线粒体系统发育关系，结果支持裂腹鱼亚科与金沙鲈鲤构成单系群。⑵成功克隆了裂腹鱼15个代表物种的Fgfr1a基因CDS序列，长度为2064 bp，其中尖裸鲤的序列有一处3 bp缺失。分子系统发育分析提示Fgfr1a基因受到功能约束，且特化和高度特化等级裂腹鱼的酪氨酸激酶结构域具有一致的氨基酸变异。⑶成功克隆了裂腹鱼5个代表物种的Edar基因CDS序列，长度586～610 bp，不同物种序列与斑马鱼相比存在各自的插入缺失，且不同等级裂腹鱼在第10个外显子处有不同数目的(AAC)n和(CAC)n重复，蛋白水平上表现为不同数目的组氨酸重复。研究结果支持青藏高原裂腹鱼亚科鱼类鳞片发育相关基因中存在结构变异，提示这些基因在裂腹鱼真皮骨结构表型的适应性演化过程中发挥了重要作用。