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目的:探讨RUNX1-RUNX1T1阳性急性髓系白血病（acute myeloid leukemia,AML）患者在二代基因测序技术（next-generation sequencing,NGS）检测下的合并基因突变谱、临床特征及预后的影响因素。方法:回顾性分析2016年1月至2020年12月就诊于我中心的初治RUNX1-RUNX1T1阳性AML患者共113例,收集患者治疗前血常规、骨髓涂片、流式、染色体、基因突变等临床资料,并将至少完成2疗程巩固化疗或接受异基因造血干细胞移植（allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT）的患者纳入预后分析,明确患者的临床特征及预后影响因素。结果:本组113例初治RUNX1-RUNX1T1阳性AML患者中位年龄46岁,性别比例接近1:1,初诊中位白细胞数为7.4×10~9/L,骨髓中位原始细胞比例为57.00%。101位患者有染色体结果,其中70.30%（71/101）有附加染色体异常（additional chromosome abnormalities,ACA）。111例患者行二代基因测序,其中89.19%（99/111）的患者具有至少一种基因突变,最常见的基因突变为KIT（39.64%）、NRAS（19.81%）和FLT3（15.32%）。按功能分类,酪氨酸激酶信号通路相关突变最常见（65.77%）,其次为表观遗传学调控相关突变（25.23%）,合并1～2个基因突变的患者多,均为33位（29.73%）,这些基因突变中,最常见的突变组合为KIT/NRAS（8.11%,9/111）。＞45岁的患者较≤45岁的患者KIT D816比例高（P=0.033）。白细胞＞25×10~9/L较≤25×10~9/L患者ASXL1（P=0.029）、NRAS（P=0.024）、酪氨酸激酶信号通路（P=0.011）的比例均高。在纳入预后分析的64名患者中,初诊时白细胞数越高,总生存（overall survival,OS）时间越短（P=0.03）,无病生存（relapse free survival,RFS）无统计学意义（P=0.234）。合并KIT D816突变的患者OS及RFS明显缩短（P=0.007,P=0.003）,合并FLT3的患者同样拥有较差的OS及RFS（P=0.002,P=0.002）。按功能分类,酪氨酸激酶信号通路相关基因阳性患者拥有较差的OS及RFS（P=0.015,P=0.021）,根据表观遗传调控/DNA甲基化（C）、粘连蛋白复合物（C）和剪接体（S）基因突变的存在或缺失来定义两个基因亚组:CCS阳性和CCS阴性,CCS阳性组患者与CCS阴性组相比OS（P=0.078）、RFS（P=0.512）差异没有统计学意义,但是生存曲线可见CCS阳性患者OS及RFS较阴性有预后良好趋势。微小残留病（minimal residual disease,MRD）中,2疗程后流式转阴的患者拥有更好的OS及RFS（P=0.007,P=0.047）,而RUNX1-RUNX1T1定量4疗程化疗后下降超过3个log值的患者OS及RFS无统计学意义。多因素分析中,白细胞计数、KIT-D816、2疗后流式为影响OS的独立危险,KIT D816、FLT3、2疗程后流式是影响RFS的独立危险因素。影响微小残留病的因素分析中,2疗程后流式阴性的患者FLT3-ITD基因突变阳性比例明显低于阳性患者（P=0.046）。而RUNX1-RUNX1T1定量4疗程化疗后下降超过3个log值的患者KIT D816突变比例较未达到3个log值的患者比例低（P=0.012）。结论:1、RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性AML有附加染色体异常的占70.30%,性染色体缺失占53.47%。2、RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性AML高达89.19%的患者在诊断时出现中位数为2（1～8）个的基因突变,合并1～2个基因突变的患者多,其中最常见的突变是KIT突变,其次为NRAS、FLT3,按功能分类酪氨酸激酶信号通路相关突变最常见,其次为表观遗传学调控相关突变。3、年龄＞45岁的患者KIT D816突变比例高。而WBC＞25×10~9/L的患者ASXL1、NRAS及酪氨酸激酶信号通路基因突变基因比例高。4、单因素分析中初诊时白细胞计数、KIT D816、FLT3、酪氨酸激酶信号通路相关突变、2疗程后流式MRD为影响OS的危险因素。KIT D816、FLT3、2疗程后流式MRD为影响RFS的危险因素。5、多因素分析中初诊时白细胞计数、KIT D816、2疗程后流式MRD为影响OS的独立危险因素。KIT D816、FLT3、2疗程后流式MRD为影响RFS的独立危险因素。6、FLT3-ITD基因突变影响2疗后流式,KIT D816影响4疗后RUNX1-RUNX1T1。