TRIB3的生物信息学分析及其在胃癌细胞中的表达研究

来源 :青岛大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangyuantianjin99se
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的胃癌是最常见的肿瘤之一,中国的胃癌发病率和病死率尤高,因此针对胃癌的机制研究尤为迫切。Tribbles同源物3是一类假性蛋白激酶,在人体内参与调控多条信号通路,从而介导了多种疾病的发生发展,在糖尿病、冠心病、肥胖、阿尔兹海默症等疾病中发挥着重要作用。国内外学者均发现,TRIB3被发现在多种肿瘤中高表达,且导致了肿瘤的增殖、侵袭和转移。而TRIB3在胃癌中的作用研究匮乏,本课题针对TRIB3在胃癌中的作用进行研究。拟明确TRIB3在胃癌细胞中的相互作用蛋白、参与调控的信号通路及发挥的主要功能,并探讨TRIB3与胃癌患者临床、病理特点的关系。材料与方法1.生物信息学分析:Link Omics在线数据库中有415个胃癌标本,每个标本均有完善的临床病理数据,均来源于TCGA数据库。利用生物信息学分析方法探求TRIB3在胃癌细胞中的相关蛋白,并进行GO分析和KEGG分析。最后将TRIB3与胃癌临床数据进行相关性分析。2.免疫组化:本课题收集了60例胃腺癌组织标本及对应的癌旁组织标本,标本均来源于青岛大学附属医院。进行了区域目标的筛选后,制作了组织芯片蜡块。组织芯片蜡块切片后制作成组织芯片,采用免疫组化的方法检测了胃癌细胞及癌旁组织中TRIB3的表达。结果1.生信分析结果:(1)在胃癌细胞中,TRIB3有12386个相关蛋白(P<0.05)。其中表达正相关的基因有5987个,如C20orf20(p=3.21-E42),UBE2C(p=7.62-E41);表达负相关的基因有6399个,如PDE4D(p=7.73E-34),FAM13B(p=1.61E-32)。(2)GO分析以明确TRIB3在胃癌细胞中的功能,结果示:TRIB3与NF-k B结合功能、与t RNA结合功能等有正相关,与β-catenin结合功能、与细胞因子结合功能等有明显的负相关。(3)利用KEGG分析探求TRIB3在胃癌细胞中调控的信号通路,我们看到TRIB3主要与碱基的切除修复、细胞周期、类固醇生物合成等通路密切相关。(4)TRIB3表达越高的患者,其局部分期(T分期)越高。年龄越大的胃癌患者,TRIB3的表达越高。不同人种中TRIB3的表达亦不相同,黑种人TRIB3的表达与胃癌发病相关性最高,黄色人种次之,白种人最低。2.免疫组化的结果:(1)研究中60例胃癌标本中TRIB3的阳性表率为46.7%(28/60),而癌旁组织中TRIB3的阳性表达率为20%(12/60),TRIB3在癌组织中的表达明高于在癌旁组织中的表达(P=0.002)。(2)将TRIB3的表达与临床病理相关因素的分析结果:TRIB3的表达与胃癌的TNM分期与远处转移密切相关(P<0.05),而与年龄、性别、肿瘤大小、分化程度无明显相关性(P>0.05)。结论 生物信息分析发现TRIB3在胃癌细胞中有多个相关蛋白,参与调控多条信号通路,T分期越高的患者TRIB3的表达越高。我们进行免疫组化发现,TRIB3与胃癌TNM分期及远处转移有相关性,而TNM分期指导患者治疗策略,预测患者预后及生存时间。TRIB3可能是评价胃癌生物学行为的有效指标,或能指导胃癌的治疗及预测疗效。
其他文献
调节二甲醚(DME)与天然气的体积比,在火焰筒试验台上测试了燃烧器的组分响应,在小型工业炉窑上测试了传热与燃烧性能.结果表明:与纯天然气相比,天然气掺混二甲醚时热效率变化不
民法上的相邻权是指相邻各方对各自所有的或使用的不动产行使所有权或使用权时,基于法律规定而派生的享有在他人不动产上的权利。如相邻的权利人享有他人不动产上必要的通行权
报纸
曹植的《洛神赋》一直受到人们的推崇,并对我国的古典绘画艺术和书法艺术产生深刻影响。关于曹植《洛神赋》的创作背景,有一个颇为流行的“感甄故事”和“感甄说”。本文从文
1引言稳健性原则的运用可追溯到15世纪早期,最初在民商法中被用于强化债权人(特别是银行)权益的保护,后来演变成了世界主要国家会计准则制定机构所普遍接受的会计原则。通常,
清代的雍正、乾隆年间,词的创作进一步向前发展,当时的词坛非常注意从顺康词坛获取资源,一方面努力学习,一方面试图超越。本文以《雪狮儿》咏猫和《天香》咏烟草这两次唱和活
广告在人们的生活中越来越普遍,随着文化交流的发展,英文广告也逐渐渗透进我们的生活中.本文主要分析了英文广告的特点及翻译技巧.
阐述了地铁工程填土区域的勘察要求、方法及内容,并分析评价了填土的成分、工程特性及物理力学指标,同时结合地铁工程建设的特点,对某区域分布的填土提出相应的处理意见及相关建
【正】美国一项针对3300名退休老人的民调显示,对于退休后生活,81%的老人担心健康,58%的老人担心养老生活保障,36%希望家庭和谐,2 0%的人希望重新建立目标,5%的人渴望不断尝
期刊
目的评价DHA亚麻籽油微襄粉(海韵康)调节妊娠期糖尿病患者血糖血脂的效果。方法选取我院2017年1月~2018年12月150例妊娠期糖尿病患者作为研究对象,按照随机数字表法分为试验
本文以新型建筑铝合金模板为研究对象,介绍铝合金模板的发展和使用情况,了解铝合金模板的工艺优点及局限性,通过实际案例分析铝合金模板体系的技术性和经济性,总结出铝合金模