伴随着中国经济的快速发展，中国社会开始进入社会转型期，各种社会问题和矛盾逐渐显现。党中央提出加强和创新社会管理的新主张，要求采取创新的方式对社会进行有效管理。农村社会管理作为社会管理的重要组成部分，必须加以足够重视。当政府管理逐级深入，必然会进入到农村领域，此时势必会与原有的村民自治制度产生交叉和重合。村民自治作为我国群众基层自治制度的重要组成部分，自改革开放以来对推进中国农村社会的发展起着非常重要的作用，被法律加以明文规定，有着不可动摇的地位。所以当农村社会管理与村民自治相互碰撞时，如何正确处理二者之间的关系尤为重要。本文以探求构建农村社会管理与村民自治之间的有效衔接和良性互动为导向，对农村社会管理以及村民自治间的关系进行了分析，并对二者进行相关比较，得出异同点，对正确处理二者关系的必要性和原则加以探讨，提出在处理二者关系时应坚持政府管理的介入不侵犯村民自治权、行使村民自治权不排斥行政权力介入以及坚持政府管理与村民自治良性互动等原则。同时结合实地调研，对不同地区在加强和创新农村社会管理过程中处理与村民自治关系的层面进行正反两个方面的评价，进而给出正确处理二者关系的建议，提出从完善法律规定、创新体制机制以及工作方式等角度出发，推行有限行政从而实现农村社会管理与村民自治的有效衔接和良性互动。