创新是广泛的经济、科技、政治和社会行为的综合，是当代经济发展的主题，是区域经济长期可持续发展的重要手段，是经济增长的内在因素。区域经济发展实绩的差异表明，不同区域的区域创新在效率方面存在着重大差别。创新与专利天生就是合一的，是密不可分的。创新的成果要转化为经济效益，必须有相应专利制度与之相配合，专利不仅能够激励创新的不断产生，是创新的动力，而且凭借其对专利权人的保护，能够使得创新的周期缩短，从而使创新的进程加快。为了深入研究基于专利的区域创新效率低下的原因和对策，本文运用数据包络分析方法，以专利作为产出指标构建区域创新效率分析的指标体系，并依据2001—2005年连续五年的数据，对我国30个省和直辖市的区域创新效率进行了分析。指出了一些地区存在的不足和改进方向。最后根据分析的结果，提出了一些提高区域创新效率的政策建议。本文共分六个部分：第一部分为绪论，简单概括了论文研究的背景，阐述了研究区域创新效率的意义，给出了本论文的研究思路和结构。第二部分为国内外研究的回顾与评述。在本部分，文章从区域创新理论和创新效率两个方面入手，简要回顾了国内外关于区域创新及其效率研究的理论成果，系统总结了区域创新效率的理论基础，并指出从专利视角研究区域创新效率的意义。第三部分为区域创新效率评价的指标体系和模型选择。在前面的理论基础上，文章构建了以专利为产出指标的区域创新效率评价的指标体系；介绍了数据包络分析的原理和论文研究使用的模型。第四部分为我国区域创新效率评价的实证研究。依据2001—2005年连续五年的数据，对我国30个省和直辖市的区域创新效率进行了分析，并根据分析结果，对这30个地区进行了重新分类，指出了一些地区存在的不足和改进方向。最后，文章从内部机制和外部机制两方面上提出了如何提高区域创新效率的政策建议。