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番茄根结线虫病害是由根结线虫引发的目前番茄在设施栽培中最为严重的土传病害之一。前人研究表明,番茄连作土中添加菊芋秸秆可有效防治番茄根结线虫病害的发生。菊芋品种资源丰富,不同品种菊芋对于番茄根结线虫病害的影响是否表现一致缺少进一步的研究。因而有必要探明不同品种菊芋秸秆对于番茄生长及根结线虫病害的影响。本研究首先选取5个菊芋品种,通过实验室试验从中筛选出3个品种,通过盆栽试验和高通量测序技术研究不同品种不同浓度的菊芋秸秆对番茄生长及番茄连作土土壤微生物群落结构、微生物多样性的影响。旨在探明添加不同品种菊芋秸秆在番茄生长、根结线虫病害防控及土壤生态中发挥的重要作用。本试验所得主要结果如下:(1)菊芋秸秆对番茄长势影响不同,1%添加量长势优于2%添加量。1%J13长势最好,其次是1%J04、1%J01。添加2%菊芋秸秆对于番茄根结线虫病害的防治效果优于1%菊芋秸秆。2%J01的发病情况最弱。(2)不同品种菊芋秸秆对于南方根结线虫的影响存在差异,菊芋秸秆浸提液浓度在2%时对于南方根结线虫的抑杀效果要优于1%。2%J13对于线虫的抑杀效果最好,菊芋品种J01对于根结线虫的抑杀效果最弱。(3)土壤速效钾含量与番茄根结数极显著负相关。土壤速效钾及全钾含量与土壤线虫虫口密度极显著正相关。添加菊芋秸秆可显著增加土壤速效钾含量且2%菊芋秸秆添加量优于1%菊芋秸秆添加量,2%J13速效钾含量最高。(4)添加菊芋秸秆可提高土壤真菌和细菌的丰富度和多样性,其中2%J13对于土壤细菌和真菌的影响最为明显。添加菊芋秸秆改变番茄连作土壤微生物群落结构,品种之间对于土壤微生物群落结构影响存在差异。添加1%J13菊芋秸秆对土壤微生物真菌群落结构影响最大,添加2%J01菊芋秸秆对土壤微生物细菌群落结构影响最大。(5)番茄连作土壤微生物菌群与土壤线虫虫口密度的相关性高于与番茄根结数的相关性。