乡镇集体企业作为中国经济体制改革的制度变迁产物。它的迅速崛起，已成为推动我国国民经济增长的重要力量。然而，随着改革的进一步深化和企业自身的发展，乡镇集体企业表现出了其自身的体制劣势，尤其是治理结构存在的问题束缚了企业的发展，这就需要我们进一步完善乡镇集体企业的治理结构。 论文首先回顾了国内外公司治理的研究动态，并全面系统地介绍了公司治理的内涵及其一般理论。接着，在实证分析我国乡镇集体企业发展历程的基础上，对其产生与发展的原因进行了深入剖析，由此揭示出我国乡镇集体企业进行治理结构改革的必要性，并进一步评价了我国乡镇集体企业已经历的承包制、股份合作制、股份制三种治理结构变迁。然后，深入剖析了目前我国乡镇集体企业治理结构存在的产权模糊、“行政干预下的”内部人控制、股权结构以及家族式集权管理等主要问题及其成因。最后，针对我国目前的现实背景，论文指出了乡镇集体企业治理结构改革的基本思路是共同治理与相机治理相结合，并指出从推进产权制度改革、规范股东大会、董事会、监事会等方面来加强内部治理，以及从完善市场竞争机制等方面来加强外部治理。