我国是传统农业大国,近年来,“三农”问题一直困扰着我们。尤其是伴随着城市化进程的加快,大量农村土地被征收,集体经济组织因此获得了较大数额的征地补偿款,由此衍生出一系列征地补偿款分配纠纷案件。众所周知,我国农村土地属于集体所有,农户只享有土地承包经营权,故征地补偿款的分配主要是以村集体经济组织主导进行的二次分配。且由于现行法律规定较为模糊,具有不明确性,导致对该类案件进行审理时裁判尺度不一,造成同案不同判现象。这不仅引起有关部门和广大群众的质疑,影响后续同类案件的审理,而且很难使当事人服判息诉,甚至最后会影响到司法的公信力和权威性。为此,我们要积极寻求合法、合理的途径妥善解决此类纠纷,保护农民合法权益,维护社会安定有序。本文以兰州新区为例,通过对该类案件的梳理概括,归纳出审理这些案件面临的司法困境,并对此进行了深入研究,寻找出在现行法律框架下解决此类困境的可行性办法,最后提出二元化的征地补偿制度,以推动征地补偿款分配纠纷有效解决。