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大花三色堇(Viola×wittrockiana)是堇菜科堇菜属重要的观赏植物,其花色艳丽、花姿优美、花期颇长,耐寒,是重要的花坛和盆栽花卉。杂种优势利用已成为当前国际盛行的育种途径。然而当前杂交亲本组合的选配存在一定的盲目性。本研究分别采用表型、SRAP和RSAP标记分析了9个大花三色堇和角堇自交系间的遗传差异,并以Griffing完全双列杂交Ⅲ配制了72个杂交组合,测定了14个性状的一般配合力和特殊配合力,分析了F1代观赏性状的杂种优势,以及F1代的耐高、低温特性,得出以下结果:1、基于15个表型性状、RSAP标记、SRAP标记分析的亲本遗传距离和聚类结果不尽相同。其中基于表型性状和RSAP标记的自交系S1和S9间的遗传距离最小(分别为2.76和0.37),而基于SRAP标记自交系S1和S2的遗传距离最小(0.47);基于表型性状的自交系S7和S9之间的遗传距离最大(10.18),RSAP标记S6和S7遗传距离最大(0.79),SRAP标记S2和S7遗传距离最大(0.75)。基于表型性状,S1和S9自交系被聚为一类,其他聚为一类;RSAP标记把亲本分为两类:第Ⅰ类是S1、S2、S6和S9自交系;第Ⅱ类为S3、S4、S5、S7和S8自交系;而SRAP标记把自交系被分为四类:S3单独为一类,S7单独为一类,S4和S5一类,其余聚类一类。2、自交系S7在增大花径方面一般配合力最大(6.11);S1和S9的花数一般配合力最高(2.05和4.49);S2的株型配合力最小(-0.11)。而花径和花数作为主要育种目标,优势组合为S5×S2、S6×S4、S6×S7、S7×S2、S7×S3、S7×S4、S8×S4。花径、花数和叶长的广义遗传力(73.85%、79.16%和64.53%)及狭义遗传力(64.09%、45.82%和53.28%)较高,可进行早代选择;其他性状的广义和狭义遗传力均较低,应进行高代选择。3、基于表型的各亲本间遗传距离与F1代的花数、花葶长、株幅、叶数和分枝数的杂种优势之间极显著负相关,表型遗传距离不足以预测杂种优势。而基于RSAP和SRAP各亲本间遗传距离均与株高、叶型的杂种优势显著正相关,基于SRAP的各亲本间遗传距离与花葶长杂种优势极显著正相关,用DNA标记遗传距离预测部分性状杂种优势具有一定的可靠性。4、对杂交F1代分别进行35℃持续一周的高温处理与-8℃10h低温胁迫处理,基于4个抗性指标(逆境存活率、抗性等级、电解质外渗率及叶绿素荧光参数(Fv/Fm))的主成分和聚类分析将71个杂交F1代分为高度耐热型、中度耐热型、弱耐热型和热敏感型4种类型;将69个F1代分为高度耐寒、中度耐寒和不耐寒3种类型。