内蒙古白绒山羊HGT序列及结构的特征分析

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内蒙古白绒山羊是一种优良家畜品种,通过EST(表达序列标签)测序在分子水平上获得大量数据,这些数据提供了内蒙古白绒山羊的部分基因信息,为进一步研究与山羊绒生长相关基因奠定基础。本实验选择内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期cDNA文库为研究材料,其中15条HGT (高甘氨酸/酪氨酸角蛋白关联蛋白)的cDNA序列已被国际公共数据库—GenBank数据库接受,其中KRTAP6(角蛋白关联蛋白家族6)家族成员6个,KRTAP7家族成员1个,KRTAP8家族成员2个,KRTAP16成员6个。通过对不同物种HGT氨基酸序列的比较分析,发现山羊HGT的氨基酸序列与其它哺乳动物如人、小鼠和绵羊的HGT氨基酸序列有很多一致或保守的区域。分析其蛋白功能位点,发现在山羊的HGT中有许多豆蔻酰化位点。通过对白绒山羊HGT蛋白的二级结构预测,发现绒山羊HGT和其它物种HGT的二级结构中无规则线性长链结构所占比例最多,β-伸展结构占到了较少的部分,几乎没有发现α-螺旋的存在。
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