PARP-1基因多态性与肺癌易感性和放射敏感性关系的研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:js_wjj
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目的:  探讨聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1(PARP-1)基因位点rs3219073多态性与中国人群肺癌易感性及放射治疗40Gy时肿瘤退缩率间的关系,寻找影响肺癌放疗敏感性的基因位点。  方法:  研究对象为北方地区汉族人群,并且相互之间无血缘关系。在签署知情同意书后,留取外周血标本,同时完成流行病学调查。采用病例对照原则,病例组645名来自中国医科大学附属第一医院、沈阳军区总医院和辽宁省肿瘤医院,有明确病理诊断的原发性肺癌患者,鳞癌240例、腺癌217例、小细胞肺癌188例;对照组643名来自同期沈阳军区总医院体检中心的健康人群。所有病例和对照均在2009年9月至2012年12月期间收集。病例组中符合以下条件的行放射敏感性测定:①明确病理诊断的NSCLC;②行胸部病灶三维适形放射治疗能测得放疗前及放疗中20次(40Gy)肿瘤大小;③放射治疗未中断者;④未行肺部手术切除者;⑤放射治疗40Gy间未行化疗者,其中符合以上条件且肺内有可评估病灶的患者共141例,鳞癌89例、腺癌52例。采用Siemens直线加速器和6MV-X线的三维适形放射治疗(3D-CRT)进行体外照射,要求95%处方剂量线覆盖95% PTV体积。处方剂量为2Gy×20f,达到40Gy后重新扫描CT。每次CT扫描检查同首次CT摆位条件、参考中心一致。在计划系统中采用交互信息法进行CT-CT配准(放疗40Gy的CT与放疗前CT配准),参考配准图像进行靶区勾画,根据肿瘤大小变化重新勾画肿瘤靶区,命名为GTVS、CTVS、PTVS。每次由同一位主治医师和同一位主任医师共同勾画靶区,每次靶区勾画采用计划系统设定的固定窗宽、窗位。肿瘤退缩率=(放疗前肿瘤体积GTV-放疗40Gy时肿瘤体积GTVS)/放疗前肿瘤体积GTV×100%。  所有参与研究的个体外周血标本采集使用枸橼酸钠抗凝试管,每人采血约2ml,用酚-氯仿法提取基因组DNA。采用Taqman real-time PCR方法及SDS(美国应用生物系统公司)软件程序进行单核苷酸多态性的基因分型。在每个96孔检测单元中分别设立阴性对照和重复标本作为质量控制;阴性对照中不加模板DNA,而以双蒸水代替,用于检验是否存在PCR污染。每个SNP的信号强度需在两个尺度上满足形成三个明显的簇,随机选择10%的样本进行盲法重复测量。PCR反应体系共5μl,包括2X Taqman Master Mix2.5μl,20X引物与探针混合物0.25μ1,H201.25μl,DNA1.00μl。PCR扩增:95℃预变性10min;92℃变性30秒,60℃退火以及延伸1分钟;共47个循环。以SDS(美国应用生物系统公司)软件Allelic Discrimination程序进行终点分析,判断待测样本的多态性基因型。利用SPSS13.0软件进行数据整理分析,所有的统计检验均以P<0.05为有统计学显著性差异。  以x2检验比较人口学特征、相关危险因素暴露及SNPs基因型在病例与对照之间分布的差异;以拟合优度x2检验对照的Hardy-Weinberg分布平衡情况;以单因素和多因素logistic回归计算比值比(odds ratio,OR)及95%可信区间(confidenceinterval,CI)。以t检验比较肿瘤退缩率与性别,年龄,病理类型的关系,以方差分析比较肿瘤退缩率与分期和基因多态性的关系。  结果:  PARP-1基因位点rs3219073多态性与肺癌易感性:所有病例调整年龄和吸烟状态后,发现携带有PARP-1基因rs3219073位点G/G基因型的人比携带有C/C基因型的人患肺癌的风险明显降低(P=0.045 OR=0.625),合并C/G、G/G后仍有统计学差异(P=0.042,OR=0.637);分层分析得出,在病例组腺癌中G/G基因型所占比例明显低于对照组,差异有统计学意义(P=0.015,OR=0.543)。合并C/G、G/G后仍有统计学差异(P=0.027,OR=0.595),进一步校正年龄和吸烟状态后,在病例组携带有C/G基因型和携带有G/G基因型与对照组相比都可以降低肺癌发病风险(P=0.045,OR=0.566; P=0.013,OR=0.489),合并C/G、G/G后统计学差异更显著(P=0.018,OR=0.528)。  PARP-1基因位点rs3219073多态性与放射敏感性:141例可测放射治疗前及中病例组的基因型C/C、C/G、G/G分布频率分别是14.2%、44.7%、41.1%。各基因型与非小细胞肺癌患者的性别、年龄、吸烟状态、病理类型及临床分期均无统计学差异(P>0.05)。此位点C/C基因型的非小细胞肺癌放疗后肿瘤退缩率明显高于基因型C/G和G/G(P=0.045)。吸烟的非小细胞肺癌肿瘤退缩率高于非吸烟者(P=0.047),肿瘤退缩率与临床分期,原始肿瘤大小,病例类型等无相关性。  结论:  1.发现PARP1基因rs3219073位点多态性与肺癌易感性相关,其携带G等位基因降低了肺癌发病风险,在腺癌中这种保护作用更为明显。  2.PARP-1基因rs3219073位点多态性与非小细胞肺癌放疗敏感性相关,携带G等位基因的患者放射敏感性低。  3.吸烟状态与肿瘤放射敏感性相关,吸烟患者与非吸烟患者比肿瘤放射敏感性高。
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