随着互联网药品交易B证、C证审批的取消,长期以来的医药电子商务资质门槛被打破,众多医药公司、物流公司以及互联网公司纷纷布局医药电子商务,传统医药流通企业G公司顺应“互联网+”发展和医药行业变革的大背景,建立以B2B模式为主的医药电子商务平台。放开审批、行业竞争变激烈的同时,医药电子商务平台运营管理存在的问题也在G公司B2B平台中频频暴露出,如活跃客户占比持续低迷、物流配送效能低和“线上运营线下交易”等问题,面对这一系列问题导致的平台运营管理困境,只有通过优化平台自身运营管理关键环节,才能在竞争激烈的医药电子商务市场中破局。本文共分为七个章节。首先对比分析了国内外医药电子商务发展现状,并就医药行业电子商务分类和相关理论进行了阐述。同时,为更好地结合G公司实际情况进行研究,本文总结梳理了 2013年至2021年期间我国医药电子商务领域相关法律法规,以及伴随政策调整,对医药电子商务发展的影响。通过查阅大量文献,整理汇总了影响医药电子商务平台运营管理的六方面因素,即分别是运营战略、采购供应、营销策略、物流配送、售后服务、政策因素,再将六个方面因素分析、细化、归纳为36项具体因素。针对G公司医药电子商务平台运营管理存在的问题,邀请G公司电商部、质量部、物流部等人员进行问卷调研,排序找出对平台运营管理困境影响最大的10项具体因素,再以构建解释结构模型的方法,发现药品品规数量、定价策略、配送时效性存在不足是导致G公司医药电子商务平台运营管理存在问题的根本因素。结合当前大数据的广泛应用和G公司电商部实际情况,针对性的从商品供应、物流平台、定价策略、多元化发展方面设计优化策略,最后提出相应的保障措施。通过本文研究表明:（1）传统的医药批发和零售企业向医药电子商务行业布局和转型,关键是如何从企业自身的战略定位和资源优势出发,构建新型医药电子商务平台是新的技术与传统产业的有机完美结合;（2）在医药电子商务平台运营管理实际应用中,必须突破线上线下一体化、攻克技术壁垒,根据实际情况制定符合本企业的有效的优化策略和运营保障,使医药电子商务平台安全、经济、便利、高效地为企业和社会服务;（3）以传统医药企业运营管理框架为基础,医药电子商务平台要充分融入“互联网+”思维,发挥互联网多变和互通的优势,不拘泥于“小”的平台模式,整合互联上下游客户、累积的大数据等方面资源,这样才能真正做“大”平台。