犬MC1R基因T105A和R306Ter位点多态性与毛色性状相关性研究

来源 :锦州医学院 辽宁医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhenlijinping
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目的:利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测犬MC1R基因中T105A和R306Ter位点的多态性,分析该多态性与犬毛色表型的相关性,为遗传育种,培育出更加优良的实验用犬奠定基础。 方法:抽取139只杂种犬血液并提取DNA,记录毛色表型。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术,对其MC1E基因T105A和R306Ter位点分别进行基因多态性分析,并对两个位点进行克隆测序。用二元变量相关分析的统计学方法分析位点多态性与毛色性状之间的相关性。结果:PCR-RFLP分析结果表明,T105A位点序列具有多态性,表现为A、B二个等位基因和AA、AB及BB三种基因型。A、B等位基因频率分别为72.97%和27.03%,基因杂合度(H)为0.39。基因型AA频率为55.86%,BB为9.91%,AB为34.23%。对T105A多态性片段克隆测序发现,MC1R基因在编码第105位氨基酸的密码子第一个碱基存在由G到A的单碱基突变,该突变导致第105位氨基酸发生由丙氨酸向苏氨酸的改变。另外,在其他位点还存在多个碱基突变。PCR-SSCP分析结果表明,R306Ter位点序列具有多态性,表现为C、D二个等位基因和CC、CD及DD三种基因型。C、D等位基因频率分别为56.25%和43.75%,基因杂合度(H)为0.49。基因型CC频率为30.68%,DD为18.18%,CD为51.14%。对R306Ter多态性片段克隆测序发现,MC1R基因在编码第306位氨基酸的密码子处存在一个由CGA到TGA的终止突变。经统计分析结果表明MC1R基因多态性与毛色性状不存在显著的相关性,这可能是由于外科手术学教学用犬是杂种犬,其遗传背景不同所致。 结论:由于MC1R基因的T105A和R306Ter位点内存在碱基变异,因此在杂种犬中表现出明显的PCR-RFLP和PCR-SSCP多态性。在本研究群体中,该多态性与杂种犬毛色性状没有表现出显著的相关性,尚需在纯种犬群体中进一步研究。
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