马铃薯糖转运蛋白StSWEET基因的克隆及功能分析

来源 :青海大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:chi421
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
马铃薯是我国主要的四大作物之一,光合产物糖类的转运为马铃薯块茎形成提供物质基础,马铃薯叶片中同化产物的长距离运输及卸载是关键环节。糖转运蛋白SWEET可以双向转运糖类,还在生长发育、代谢过程和胁迫中发挥重要的功能。本实验根据马铃薯双单倍体全基因组数据库作为数据来源,结合拟南芥和番茄SWEET基因家族,对马铃薯糖转运蛋白(StSWEET)家族进行鉴定和系统的生物信息学分析,并研究了StSWEET家族在青薯9号马铃薯中不同组织的表达谱;StSWEET基因家族在青薯9号马铃薯的生物胁迫与非生物胁迫下的表达。基于表达情况,对StSWEET11和StSWEET16b基因进行了同源克隆及功能分析。1、本文分析得到马铃薯StSWEET家族中有33个基因,命名自StSWEET1-StSWEET17;与已发表的番茄SlSWEET家族29个基因、拟南芥AtSWEET家族35个基因进行聚类。SWEET家族被聚为4个亚族,第一亚族有6个,第二亚族有32个,第三亚族中含有51个,马铃薯SWEET家族占有19个,第四亚族仅有2个,马铃薯大部分基因归于第三亚族。基因结构分析表明每个开放阅读框的内含子数量都不一样,其结构比较保守。StSWEET基因家族基本成簇分布在10条马铃薯染色体上,10号和11号染色体没有分布,StSWEET12d基因目前还未被定位。StSWEETs蛋白家族具有10个保守基序,同一亚族中的蛋白含有相似的保守基序组成,其在每亚族中具有相似的功能。启动子预测分析表明马铃薯SWEET蛋白与细胞生长、发育、次生代谢以及响应生物与非生物胁迫等相关。2、利用qRT-PCR技术分析马铃薯StSWEET基因家族在青薯9号中不同组织表达谱。研究表明大部分StSWEET基因家族在不同组织中呈现特异性表达,在某一组织的特异性表达可能参与了组织的生长发育,调控了相应的功能。StSWEET11基因在叶中特异性高表达,StSWEET16b基因在花中特异性高表达。在根中StSWEET10c的表达最高,StSWEET12e低表达;在茎中,StSWEET1h的高表达,StSWEET1f表达量最低;StSWEET11在叶中表达较高,StSWEET17表达量最低;在花中StSWEET1e高表达,StSWEET1f表达较低;在块茎中StSWEET1d表达较高,StSWEET12e表达低平;在匍匐茎中,StSWEET12c在匍匐茎中表达较高,而StSWEET17低表达。3、利用qRT-PCR技术分析马铃薯StSWEET基因家族在青薯9号的生物胁迫(晚疫病病菌浸染叶片)与非生物胁迫(葡萄糖、果糖和蔗糖处理)下的表达。研究表明StSWEET11基因响应了晚疫病病菌的生长,也对蔗糖较敏感;StSWEET16b基因与晚疫病病菌的生长紧密相关,对果糖和蔗糖稍敏感。在马铃薯晚疫病病菌诱导下,StSWEET10c和StSWEET10d在24h时达到最高表达,尤其StSWEET11的表达量显著上调。StSWEET1d、StSWEET1e、StSWEET2b、StSWEET10a和StSWEET12b的表达量存在下降趋势。在糖胁迫过程中,在根中,StSWEET3,StSWEET10b,StSWEET2c,StSWEET16b和StSWEET16c在葡萄糖胁迫后的表达下调;StSWEET12c在葡萄糖和果糖胁迫后上调,然而在蔗糖胁迫后却呈现下调;StSWEET16a仅在果糖胁迫后上调。在茎中,StSWEET16a,StSWEET17,StSWEET1e和StSWEET10a在葡萄糖胁迫后上调;在果糖和蔗糖的胁迫下,StSWEET11,StSWEET1b,StSWEET12e,StSWEET1f,StSWEET12d,StSWEET1c和StSWEET1d上调。在叶片中,StSWEET1i,StSWEET10c和StSWEET2a在蔗糖胁迫后上调,StSWEET2c在蔗糖胁迫后下调。4、基于基因表达情况,选取在马铃薯青薯9号中克隆StSWEET11基因和StSWEET16b基因。其StSWEET11的CDS为903 bp,编码301个氨基酸,分子量为33591.42 Da,等电点为9.29,具有7个跨膜域,含有两个MtN3/saliva保守结构域。StSWEET16b的CDS为786 bp,编码262个氨基酸,分子量为28838.13Da,等电点为9.66,具有6个跨膜域,含有一个MtN3/saliva保守结构域。利用Gateway技术分别构建StSWEET11基因和StSWEET16b基因的表达载体,分别以LBA4404农杆菌感受态介导进行遗传转化烟草,StSWEET11基因,得到了52株转化苗;StSWEET16b基因,得到了48株转化苗。
其他文献
本研究通过分析不同盐湖土壤理化性质,设计优化分离条件,分离纯化放线菌,同时对获得的菌株进行聚类分析和嗜盐耐盐规律探究。研究结果表明:1.各盐湖土样的含盐量都很高,在44.
在西北干旱半干旱地区,土壤水分是制约农作物生产和植被恢复的一个重要因素,提高水分利用效率对农业高效发展和生态环境重建具有重要意义。蚯蚓作为最典型的大型土壤动物之一,对土壤功能的直接作用潜力巨大,其排泄产生的蚯蚓粪具有良好的物理、化学和生物学特性,因而被广泛用于作物育苗、土壤培肥、污染修复和抑制作物病害等方面。蚯蚓粪中含有大量腐殖质可以改善土壤结构,而覆盖于地表的蚯蚓粪则能够增加地表粗糙度,进而影响
针对融媒体时代高校学术期刊发展问题,从学术期刊编辑流程再造的角度,分析了融媒体时代高校学术期刊面临的问题。借鉴流程再造理论,结合融媒体发展特点,从选题策划、组稿、审
除草剂苯磺隆对冬小麦产量指标和叶面积的影响试验结果表明,小麦产量随苯磺隆浓度的增加呈先增后降的趋势,而高浓度苯磺隆对小麦的倒2叶的叶面积有抑制作用,但随着苯磺隆降解
本文介绍了电子回旋共振加热(简称;ECRH)在磁镜装置上的实验结果,成缺地产生了稳定的热电子环(HER),由X—射线谱仪诊断结果,热电子平均温度在20—30KeV,高能尾部达160Kev,取
期刊
采用改良土壤、控制水分、有效控梢、调整树体等技术措施,对低产沙田柚园进行改良增产,实现90%以上的低产树增产,年平均株产70kg。最高植产达100kg。
非水体系锂氧气电池相比于其他新型可充电电池具有最高的理论比能量(3505 Whkg-1),单次充电能够供应电动汽车行驶超过550 km,因此具有重要的研究意义和广阔的发展前景。然而
多金属氧酸盐(POMs)是由最高氧化态的过渡金属形成的一类阴离子金属氧簇,它们展现出不同的拓扑结构和可调节的性质,已广泛用于催化、材料科学、磁学和医学领域。多酸的有机配
目的:为了解中蒙边境乌拉斯台口岸地区鼠类携带病原体情况,采用夹夜(昼)法捕鼠并采集鼠体体表寄生物,进行形态学鉴定,对鼠体进行六种病原体监测。掌握鼠体携带病原体情况,研究鼠群和蚤的关系、鼠群与周边环境的关系,评估口岸输入性媒介传染病发生的风险,为口岸传染病的防控提供科学依据。方法:2016年—2018年连续三年在乌拉斯台口岸的生活区、联检大厅周围、存储场地、野外、边境区五种生境进行媒介生物监测,对鼠
舞蹈艺术的发展过程中,舞蹈编导在其中所起到的作用是比较重要的,这就需要从多角度培养舞蹈编导的创造性思维能力,这对舞蹈编导的工作就有着很大的帮助。本文先就培养舞蹈编