【摘 要】
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本文基于系统发育比较分析方法,整合计算机模拟二级结构方法进行反义药物优化设计研究,分析构效关系与系统发育保守性在反义药物设计中的意义,进一步改善QSAR方程。筛选具有
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本文基于系统发育比较分析方法,整合计算机模拟二级结构方法进行反义药物优化设计研究,分析构效关系与系统发育保守性在反义药物设计中的意义,进一步改善QSAR方程。筛选具有应用前景的活性先导序列,考察优选序列的体内外活性。 1.选取与乳腺癌发生密切相关的HER-2为靶点,通过Genbank共获取HER-2 mRNA(4530bp与1316bp),分析HER-2 mRNA的系统发育保守性;同时利用计算机模拟靶mRNA的二级结构,将局部二级结构(局域,local motif,LMs)分为三种类型:1)完全保守局域(completely conservative LMs),即一级序列完全保守、模拟mRNA最优及次优二级结构中全部具有的LMs;2)相对保守LMs(relatively conservative LMs),即一级序列不完全保守、模拟的三个最优或次优mRNA二级结构中出现二次的LMs;3)变异LMs(variable LMs),以及序列完全变异,模拟mRNA最优及次优二级结构中只出现一次的LMs。在分析二级结构特点、计算ΔG°_R等参数的
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