海峡两岸金融合作是两岸经贸交流的重要组成部分，是两岸经济和金融一体化发展的必然趋势。但长期以来，两岸金融合作严重滞后于两岸经贸往来，呈现“大经贸、小金融”的不平衡发展格局，这严重影响到两岸经贸进一步发展。随着两岸贸易与投资规模不断扩大需要，两岸签署 ECFA，两岸金融合作已逐渐迈入“直接、双向”的“正常化、自由化和制度化”轨道。深入研究两岸金融合作，可进一步扩大两岸经贸交流与合作，提升两岸金融业整体竞争能力及一体化进程。具体来说，加强两岸金融合作，一是有利于提升海峡两岸经贸往来的效率；二是有利于提升两岸金融机构的综合竞争力；三是有利于加快利率市场化进程。囿于两岸在金融发展背景和金融体制上存在较大差异，加上长期形成的政策限制难以在短期内彻底根除，两岸金融合作仍然任重道远。　　当前，尽管深化两岸金融合作存在各种限制，例如两岸政策存有差异、两岸金融市场发展不一、两岸金融合作滞后以及金融合作的非对称性等等，但在进一步加强两岸金融合作方面仍然有着重要机遇，如 ECFA、《服务贸易协定》、自由贸易试验区、“一带一路”与“亚投行”、“大陆各地金融中心建设”等等，这为提高两岸金融合作进程带来巨大的合作空间，也是未来两岸金融合作重点突破地方。　　两岸金融合作是一个循序渐进的过程，处理好短期和长期的关系，并根据不同时期设计合理的政策，以促使政策效果更加明显。如何处理两岸金融合作的短期、中期和长期关系在以往研究中较为少见，众多学者更倾向于两岸金融一体化、两岸金融竞争力、两岸金融交流与合作必要性等角度切入，少有针对性的政策建议。本文运用Copula函数，以证券业为例，分析了两岸金融合作的关联性。结论认为，中国大陆与台湾金融市场同时发生极大值的概率相对较大，两岸金融合作所面临的市场阻碍与合作障碍影响两岸之间金融市场的关联性，两岸金融市场关联性低也是因实质存在问题尚未解决，但伴随经贸融合后，金融市场关联性会随之增加，另一方面更预示两岸金融合作潜力巨大。　　本文最后进一步提出两岸金融合作的原则与短期、中期和长期路径，认为政经分离、先行先试、遵循WTO原则、双向优惠等是两岸金融合作必须遵循的准则。以四大原则之上，短期路径选择先行先试、多管并举、重点突破等政策；中期路径选择应推动台湾建设人民币离岸金融中心建设进程；长期路径选择推动两岸四地金融一体化的政策。