软科学作为科学技术第一生产力的重要组成部分，对于加速决策科学化和民主化，以及管理现代化进程，提高我国综合国力具有重要意义。当前，我国已进入全面建设小康社会和努力创建创新型国家的关键时期。新情况、新问题层出不穷，各种利益关系错综复杂，国家更加重视决策科学化、民主化和制度化建设。面对新形势和新要求，软科学研究必将在我国重大战略、方针和政策的制定中发挥越来越重要的作用。机构兴、则事业兴，繁荣和发展我国软科学研究事业，要求我们更加重视软科学研究机构的建设。本文以软科学研究机构为对象，重点放在对其发展态势的分析和运行模式的考察上。首先，本文对软科学的内涵和软科学研究的相关概念进行了较为全面的阐述，回顾了我国软科学研究的发展历程。接着，将我国软科学研究机构的类型与职能和国外思想库进行了对比。在上述理论背景的支撑下，以历年统计数据为基础，多角度分析了我国软科学研究机构的发展态势和存在的不足，利用相关分析技术，深入探讨了影响我国软科学发展的各种因素。然后，从决策过程的角度，建立了软科学研究机构运营模式的分析框架，根据该分析框架首先介绍国外思想库的成功经验，进而，在案例调研的基础上，分析总结出我国几类较具代表性的软科学研究机构的运营模式。最后在前述章节基础上结合我国实际情况，提出了若干发展软科学研究机构的对策和建议。