表皮生长因子基因多态性与肝癌的遗传关联研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 9次 | 上传用户:shhgay
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目的:探讨表皮生长因子(Epidemal growth factor,EGF)基因单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphism,SNP),包括5’调控区的G61A、外显子1中的S16R、外显子8中的R431K、外显子14中的I708M、外显子15中的D784V与原发性肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)易感性的关系,进一步阐述影响肝癌发生的生物学机制。方法:采用候选基因的关联研究。在本研究我们涉及到两个病例-对照人群(广西肝癌病例-对照人群和江苏肝癌病例-对照人群)和一个核心家系人群(广西肝癌核心家系)。收集个体的外周静脉血(5ml/例)及流行病学和临床资料。提取DNA后,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR- -RFLP)方法对EGF基因的5个多态性位点:即5’调控区G61A、外显子1中的S16R、外显子8中的R431K、外显子14中的I708M、外显子15中的D784V,进行基因分型。应用Hardy-Weinberg test 3.0、PHASE2.0、SNPSTATS、SPSS10.0等多个软件进行数据统计分析。结果:(1)在广西肝癌病例-对照人群中,应用非条件Logistic回归分析,校正年龄、性别、吸烟、饮酒、吸烟量等因素后发现:外显子区域的四个多态性位点与肝癌的患病风险无显著的遗传学关联。(2)在广西肝癌病例-对照人群中,校正年龄、性别、吸烟、饮酒、吸烟量等因素,非条件Logistic回归分析发现:5’调控区的EGF G61A位点,与野生型GG基因型相比,AG或AA基因型可显著降低肝癌的患病风险(OR=0.749,95%CI:0.568-0.988,P=0.041)。在江苏肝癌病例-对照人群检验中同样发现,与野生型GG基因型相比,AG或AA基因型可显著显著降低肝癌的患病风险(OR=0.652,95%CI:0.432-0.985,P=0.042)。对上述两个病例-对照人群合并后的分析发现显示,与携带GG基因型的个体相比,携带AG或AA基因型的个体患肝癌的风险下降了29%(OR=0.710,95%CI:0.566-0.892,P=0.003);与G等位相比,A等位在肝癌患者中的频率显著降低(P=0.009)。为进一步验证病例-对照人群中的关联结果,我们在来自广西高发区的112个肝癌核心家系人群中进行传递不平衡检验(TDT检验),结果表明A等位显著降低传递风险(χ2=7.674,P=0.005)。(3)通过AliBaba2.1转录因子预测软件预测EGF G61A位点前后序列的转录结合因子结合情况发现,G等位提供了更多的转录因子SP1的顺式作用原件。结论:(1)EGF外显子区域的单核苷酸多态性位点:外显子1中的S16R、外显子8中的R431K、外显子14中的I708M、外显子15中的D784V,同HCC的发生之间不存在遗传学关联。(2)EGF 5’调控区的G61A同肝癌的发生显著相关。A等位可能通过等位特异的方式,降低EGF基因的转录使表皮生长因子的表达量下降,使肝癌的发生风险降低。我们的结果提示EGF基因的遗传多态性在肝癌的发生中发挥重要的作用。
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