为了适应我国经济建设快速发展的需要，国家加快了高等级公路，尤其是山区高等级公路建设的步伐。而山区高等级公路的特点是，穿越地区地质条件复杂，地形地貌条件多变，深挖高填形式多见。因此，路基病害的产生将不可避免。本论文结合内宜高速公路K96+800～K99+380段的地基工程问题，重点对山区高速公路软基变形问题进行了系统分析和研究。首先，详细研究了病害路段的工程地质条件，并对病害的类型、特征及成因机制进行了分析；同时，根据沉降变形监测结果，对变形沿路基纵横方向及随时间的变化规律进行了系统分析、总结和评价。在此基础上，根据对三种经典的沉降计算方法的改进，对软基沉降变形进行了预测评价。这三种改进的计算方法，即对分层总和法进行改进，利用编程计算，使其可应用到对任何形状填筑体荷载作用下的任意点处的地基最终沉降变形计算；将一维固结公式及双曲线法与数理统计相结合，并对双曲线法进行修正，使两种方法的应用更趋合理。另外，采用2D-FLAC有限元程序，对路基的变形稳定性进行了模拟分析，并与前三种变形计算结果进行了对比。最后，结合前述分析研究，并根据局部变形处治成效，有针对性地提出了软基病害处治方法建议。