生物手性分子螺旋结构与旋光性的理论研究

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许多生物小分子都是手性的,文中以理论化学计算的方法研究了其手性构型结构与其旋光性的关系。物质的性质是由其结构决定的,所以物质的旋光性也应该是由其某一特有的结构特征所决定。旋光性,它有明确的方向性和许多描述它的参数。螺旋结构与旋光方向和旋光度大小可以联系在一起。螺旋结构才是导致旋光性的根本原因。有些光学活性分子因测定条件不同而使旋光方向发生改变,因为不同条件下,分子构象发生了变化。构象改变后,分子结构内的螺旋方向也改变,其旋光方向也随之改变,测定条件变化,若不影响化合物构象,则其旋光方向是不会改变。旋光性受外界因素影响比较大。当在测定该类分子的比旋光度时,不同的测定条件下,得到不同的比旋光度数值,这是因为在不同的条件下,使得分子的构型特征也不相同,从而使得分子内的螺旋结构发生了变化,表现出来的旋光性也不相同。利用旋光理论,对不同类型的光学活性物质进行结构分析,找出结构和螺旋度的某种对应关系。从螺旋结构出发,可以推断光学化合物旋光度的结构。在这些理论的基础上,我们以密度泛函理论,在B3LYP/6-311++G(2d,2p)计算水平上,我们研究了2-氨基丙酰胺的旋光度和螺旋半径,螺距的关系。我们通过优化计算,得到了六种2-氨基丙酰胺的稳定构型和它们的旋光度,并计算了它们的螺旋半径和螺距,找到了他们之间对应关系。在B3LYP/6-311++G(2d,2p)基组水平上我们研究了甲酰胺(肽单元模型)对2-氨基丙酰胺旋光度的影响。我们分析了甲酰胺-2-氨基丙酰胺复合物的结构参数,能量,并计算了它们的螺旋半径和螺距。找出螺距和螺旋半径的变化对旋光性是如何影响的。进一步揭示了螺旋结构是产生旋光性的根本因素。最后我们还在B3LYP/6-311++G(d,p)基组水平上,还对甲酰胺对RNA上的碱基对尿嘧啶-腺嘌呤的氢键影响进行研究。
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