新疆北鲵(Ranodon sibiricus)，属两栖纲，有尾目，小鲵科，北鲵属。仅分布在新疆温泉县和哈萨克斯坦两国边境处极狭窄区域。形态学及分子系统学分析表明，新疆北鲵是有尾目中最原始的类群之一，进化地位十分重要。然而这种珍稀的有尾两栖类却处在灭绝的边缘，对该物种进行保护遗传学研究己刻不容缓。 本研究从我国境内目前已发现的5个北鲵栖息地中共采集103个样品，代表了新疆北鲵的主要群体。采用PCR、克隆、测序技术，获得其中55个样品的线粒体DNA的tRNA-Thr、tRNA-Pro、tRNA-Phe、D-loop区及部分Cytb和12S rRNA序列，长度约1323 bp。为了分析基因分型实验过程中误差对分析结果的影响，我们随机抽取了部分样品进行重复实验，结果表明整个实验过程中产生的误差水平是0.0022。推测这些误差可能是由测序或重组质粒在E.coli中复制产生的。 新疆北鲵线粒体D-loop区长度约799 bp，碱基A+T含量平均约为66.83％，与中国大鲵的相似。新疆北鲵群体的多态性分析显示其序列D-loop区没有多态位点。 新疆北鲵如此低的分子多态性，这在其他物种是极少见的。我们推测造成这种现象的原因主要有两个：第一，新疆北鲵的种群数量非常小，并且呈持续下降的趋势；第二，在第四纪冰川期时，温度下降使北鲵栖息地由高海拔向低海拔移动，达到冰期避难所，各群体间在此发生显著的基因交流，冰期过后又重新形成目前的间断分布。如此低的多态水平也表明新疆北鲵的物种延续存在很大危险。 本研究是国内首次利用D-loop区对新疆北鲵做群体水平上的多样性分析，为新疆北鲵保护策略的制定提供了理论依据。