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目的： 通过利用有关差异蛋白质组学相关技术（双向凝胶技术以及生物质谱分析技术）寻找出关于结肠黑变病（MC）与结肠癌、正常患者差异表达的蛋白质质谱图，应用Mascot软件在NCBInr数据库检索比对差异的蛋白质，在生物蛋白质分子水平探讨结肠黑变病与结肠癌之间的关联及差异的蛋白质，分析与临床意义相关联的蛋白质分子。 方法： 通过双向凝胶电泳技术（2-DE）获取MC与结肠癌及正常组织之间的差异蛋白质凝胶图，结合软件分析和手工筛选，查找凝胶图中表达差异大于1.5倍的蛋白质斑点，选出的差异点后通过酶解及生物质谱分析（MALDI-TOF/TOF-MS）获取相关的差异蛋白质信息并进行分析，了解其功能及产生差异机制。 结果： 根据MC与正常结肠黏膜、结肠癌的二维凝胶扫描显示图像分析获得的蛋白质斑点数量为1970±138，2028±176、2150±240，应用imagemaster7.0软件进行图像对比分析后，总共找到倍比大于1.5倍的蛋白质斑点14个。结肠黑变病（MC）和正常结肠组织相比较表达的量的差异大于1.5倍的点有6个，其中在结肠黑变病黏膜组织中表达上调的差异点有2个，表达下调的差异点有4个，仅在结肠黑变病黏膜组织中表达的差异点有1个（P＜0.05）；结肠黑变病黏膜组织与结肠癌黏膜组织对比表达的量的差异大于1.5倍的点有8个，其中在结肠黑变病黏膜组织中表达上调的差异点有1个，在结肠癌黏膜组织中表达上调的差异点有7个。仅在结肠癌黏膜组织中表达的蛋白质点有2个（P＜0.05）。质谱分析和数据库检索共鉴定出8种蛋白质，包括KRT8/18、FGB fibrinogen、CAT Catalase、PSMC626S protease、TPM4等。 结论： 生物质谱分析（MALDI-TOF/TOF-MS）很好地显示MC组织与结肠癌组织以及正常结肠组织间的蛋白质表达差异，为MC、结肠癌的研究提供新思路、新线索。本研究最终所鉴定出的8种不同表达的蛋白质，这些蛋白的不同表达表明可能参与结肠黑变病的细胞癌变，以及癌细胞的恶性增生、发展分化、迁移扩散等。