改革开放以来，中国经济增长迅速，而且中国金融部门也取得较快的发展。中国金融规模从量上已经很大，然而金融资源配置质量却不尽如意。金融资源错配一直是我国市场经济的一个重要特征。虽然近年我国金融市场化改革取得重要进展，但是资本市场市场化程度并不高，并成为阻碍经济结构优化升级的一个重要原因。实际上，企业间出现的金融错配现象本质上是企业在融资方面会出现严重差异。　　虽然有大量学者对金融资源配置有诸多探讨，甚至对金融资源错配有过深入研究，但这些研究要么集中在宏观角度，要么关注于微观角度的某个方面，而没有对微观角度进行全方位研究。本文基于内生增长理论，在运用2000-2009年中国规模以上工业区企业数据的基础上，定量分析了金融资源错配对企业创新的影响。结合差异比较分析方法，根据金融资源错配和企业创新的现状，采用分位点回归方法，按不同地区、不同行业和不同所有制，对金融资源错配与企业创新进行分样本研究。　　主要结论如下：（1）从样本总体情况来看，金融资源错配对企业创新存在着明显的抑制作用。随着分位点的增加，金融资源错配对企业创新影响程度也逐渐加深。而且，这种影响也因不同地区，不同企业性质以及不同行业而出现差异（2）从地区情况来看，由于东部地区金融资源丰富，金融资源配置效率更高，因而金融错配程度较轻，进而对企业创新的影响程度相较于中西部来说较小。所以，东部地区金融资源错配对企业创新影响不显著，而在中西部地区，则呈现与东部地区明显相反的结论。企业创新与金融资源错配的关系存在地区差异。（3）从行业情况来看，在不同性质的企业中，金融资源错配对企业创新的影响也出现了分歧。随着垄断势力增加，金融资源错配程度也逐渐加深。金融资源错配对企业创新影响存在行业差异。（4）从所有制情况来看，由于国有企业在获得金融资源方面具有较大的优势，因而其不需要创新便能获得较高的企业利润;而对于中小企业来说，创新可谓源于一种兴趣，虽然中小企业拥有的金融资源较少，但为了实现企业利润最大化也倾向于创新。因而，金融资源错配对企业创新影响存在所有制差异。　　在此研究基础上，相关部门应该注重金融资源错配现象以及它可能对企业家创新行为的抑制作用。所以，政府在制定政策的时候不能实行“一刀切”的方法，应因地制宜的按照不同行业性质、不同国有属性的企业以及不同地区的特殊情况来制定出相对应的政策。同时，应尤为关注和解决中小企业“融资难、融资贵”等问题，加快发展普惠金融，重点解决中西部地区资源错配现象严重，资源利用效率低下等问题。此外，政府部门应大力构建多样化的金融体系，提高金融市场竞争程度，优化金融资源配置，为企业创新提供支撑。