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在本研究中,我们应用RAPD,ISSR和SRAP标记对金福菇、大球盖菇、猴头菇、茶树菇菌种进行种质资源遗传多样性研究,并将RAPD,ISSR和SRAP的部分多态性片段转化成SCAR标记,分别建立上述四种食用菌的菌种鉴别技术。主要研究结果如下:1、通过金福菇的RAPD,ISSR,SRAP这三个分子标记的综合分析,采用SPSS15.0软件系统聚类法中的组间连接法进行聚类分析,在聚类阀值确定为12水平上,可将15个供试菌株分为3个群体,从这些分子标记扩增产物的图谱中,通过回收5条明亮、重复性好的特异条带,并将这5条特异带成功地转化为了SCAR标记。通过聚类分析初步判断金福菇1号和3号菌株可能为同种异名菌株,金福菇12号菌株可能不是金福菇菌株。2、通过大球盖菇的RAPD,ISSR,SRAP这三个分子标记的综合分析,采用SPSS15.0软件系统聚类法中的组间连接法进行聚类分析,在聚类阀值确定为9水平上,可将13个供试菌株分为6个群体,10号和12号菌株的遗传关系较为紧密。其中11号菌株与其他菌株的遗传距离较远,从这些分子标记扩增产物的图谱中,通过回收11条明亮、重复性好的特异条带,并将这11条特异带成功地转化为了SCAR标记。通过聚类分析,初步判断大球盖菇10号和12号菌株可能为同种异名菌株。3、通过猴头菇的RAPD,ISSR,SRAP这三个分子标记的综合分析,采用SPSS15.0软件系统聚类法中的组间连接法进行聚类分析,在聚类阀值确定为9水平上,可将33个供试菌株分为5个群体,其中12号和13号菌株,23号和24号菌株的亲缘关系很近。从这些分子标记扩增产物的图谱中,通过回收18条明亮、重复性好的特异条带,其中17条特异片段成功地转化为了SCAR标记,通过聚类分析,初步判断猴头菇12号和13号菌株可能为同种异名菌株。4、通过茶树菇的RAPD,ISSR,SRAP这三个分子标记的综合分析,采用SPSS15.0软件系统聚类法中的组间连接法进行聚类分析,在聚类阀值确定为15水平上,可将46个供试菌株分为7个群体,其中编号为32号和37号菌株的相似性系数为0.965,说明32号和37号菌株的亲缘关系很近。从这些分子标记扩增产物的图谱中,通过回收20条明亮、重复性好的特异条带,并将这20条特异带成功地转化为了SCAR标记,通过聚类分析,初步判断32号和37号菌株为同种异名。