辽河口沉积物中氨氧化微生物多样性和硝化作用研究

来源 :大连海洋大学 | 被引量 : 7次 | 上传用户:mars8244
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硝化作用是氮的生物地球化学循环过程的中心环节,氨氧化作用是硝化作用中的第一个步骤,同时也是限速步骤。氨氧化微生物在河口氨氧化过程中发挥重要的作用。于2014年5月在辽河口采集沉积物样品,并对其中的氨氧化微生物展开研究。以amoA基因作为分子标记,本研究采用实时定量PCR技术和Miseq高通量测序技术测定了辽河口沉积物中氨氧化细菌的丰度和多样性以及氨氧化古菌的多样性。此外,还通过泥浆培养实验对沉积物中的潜在硝化速率进行了测定。  本研究主要内容包括:⑴潜在硝化速率结果表明:上层沉积物中的硝化速率要高于下层沉积物中硝化速率,硝化速率的变化范围为0.4-336.8 nmol N g-1 day-1;河口向海方向硝化速率值呈现上升的趋势,说明本研究区域内硝化潜势在高盐环境要高于较低盐度的河口环境。⑵实时定量PCR实验结果显示:辽河口研究区域内,沉积物中氨氧化细菌amoA基因丰度的变化范围在8.54×104~5.85×106 copies g-1之间。各站位上层(0-2cm)样品中amoA基因丰度要高于下层(2-4cm)样品,河口向海方向氨氧化细菌丰度呈现出上升的趋势。这与河口沉积物中的潜在硝化速率变化情况相一致,表明氨氧化细菌可能在辽河口硝化过程中起着重要的作用。⑶氨氧化细菌丰富度指数的变化趋势为河口向海方向逐渐下降,均匀度指数的变化趋势也大致与丰富度指数的变化一致。氨氧化细菌系统发育分析表明:本实验中获得的氨氧化细菌amoA基因序列隶属于亚硝化单胞菌属和亚硝化螺菌属。大部分 OTU序列隶属于 Nitrosomonas marina, Nitrosomonas aestuarii和 Nitrosomonas-like lineage,部分 OTU序列属于 Nitrosospira lineage。亚硝化单胞菌属在获得序列占优势,又由于硝化潜势高的站位主要由亚硝化单胞菌属构成,因而亚硝化单胞菌属可能在辽河口沉积物中的硝化过程中发挥重要的作用。⑷氨氧化古菌系统发育分析表明:氨氧化古菌序列主要隶属于 Nitrososphaera, Candidatus和Nitrosopumilus菌属。Candidatus菌属在较高盐度的环境中具有较强的适应能力,在海洋环境氨氧化过程中可发挥重要的作用。
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