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本文以地处中国西北干旱地区新疆的一个大型微咸水内陆湖泊——博斯腾湖(简称博湖)为研究对象,研究了水体中环境因子与细菌丰度及群落结构间的关系。首先,选取6个具代表性的采样点进行了一周年(2010.6-2011.6)的水质调查。结果表明,博湖水质空间差异明显,但不同样点水质月变化无一致趋势。大湖区:西北角水域水质最差;开都河入湖处水质月变化幅度大,水质相对较好;中东部水域水质处于中间水平。小湖区:喇嘛湖水质最好,介于Ⅰ到Ⅲ级之间;北闸附近的湖沼湿地,水质差,多为Ⅴ类和劣Ⅴ类。博湖主要污染物是盐分、总氮、硫酸盐和氯化物。水体总体营养水平为中营养,部分时段达到了轻度富营养水平。农业面源污染、水文、湖流及水生植物等,是造成博湖水质时空差异的主要原因。近50年来博湖水质演变过程表明,自20世纪70年代以来,博湖已经由新疆最大的淡水湖转变为微咸水湖。伴随着湖水咸化,其它污染物浓度也快速升高。其次,于2010年6月,在全湖选取23个采样点,进一步研究了环境因子与细菌之间的关系。结果表明:博湖水体中总氮浓度变动在0.26~1.45mg/L之间(均值0.91mg/L),矿化度变动在219~1696mg/L之间(均值1125mg/L)。水体中细菌的丰度变动在1.41~4.57×106cells/ml之间(均值2.89×106cells/ml),其峰值出现在人为活动多的5号点与污染较重的西北部,最低值出现在盐度最低、污染最轻的14号点。聚类分析结果显示,博湖的23个采样点可以分为淡水区和微咸水区两个类群。微咸水区的TDS、电导率、盐度、TN、CODMn、Cl-、硫酸盐的含量及细菌的丰度均显著高于淡水区(P<0.01)。细菌的丰度与CODMn及Cl-显著正相关(P<0.01)。此外,利用PCR-DGGE研究了博湖中细菌的多样性和群落组成。根据DGGE的结果,选择6个位点的样品进行了16S rRNA基因的克隆和测序,获得374个细菌的16SrRNA基因序列。其中占优势的分别是β-变形菌(35.8%),拟杆菌(25.4%)和ε-变形菌(21.4%)。利用∫-Libshuff等软件对这六个克隆库进行统计分析,发现博湖的细菌群落有显著的空间差异。盐度是决定博湖细菌群落组成和β-变形菌丰度的关键因子,它的贡献率占20.4%。总之,博湖水质受自然和人为两种因素影响,近十年来,人为因素加剧了博湖的咸化和富营养化。细菌丰度的空间分布差异是对水体富营养化及咸化加剧的响应。位于干旱地区的博湖,细菌种类比较少,未知细菌类群所占比例高,优势种数量少。博湖中,盐度的高低是造成细菌群落组成和β-变形菌丰度异质性的主导因子。