在大数据与云环境下，企业经济效率大幅提高的同时，数据重要性也逐渐凸显。对企业而言，数据在其生存与发展中已经逐步替代了传统的生产要素居于主导地位。特别是作为企业商业秘密的创新型无形资产和竞争性商务信息已经成为企业的核心竞争力，安全与否关乎企业的生死存亡。大数据与云计算技术的飞速发展使企业商业秘密的保护面临着更加复杂的形势，从而给企业商业秘密保护带来了新的挑战。在大数据与云环境下，企业商业秘密的泄露风险空前加剧，面临着诸多挑战。首先，大数据与云计算技术本身对商业秘密的定性产生了巨大的影响。大数据技术使原本没有被纳入到商业秘密范围的数据也具有了商业秘密的价值性。云计算技术并没有改变商业秘密的秘密性而是使商业秘密的保密管理更加困难。其次，云服务合同存在瑕疵与风险。提供商与企业签订的格式条款导致企业商业秘密一旦泄露损失难以弥补，并且在有权利的政府面前，云服务提供商对用户的保密承诺都成了一纸空文。再次，云环境下的商业秘密保护立法不完善。现行法律框架下商业秘密保护范围过窄，商业秘密侵权认定、举证责任分配规则不完善，商业秘密保护法律体系不统一，数据删除权利缺乏制度保障。最后，在云环境下仅仅依靠云服务提供商和政府的自觉性实行自我管理而没有中立的第三方机构去约束的制度显然不可靠。针对大数据与云计算环境下商业秘密保护面临的挑战,借鉴域外经验，尤其是欧盟、美国做法，并结合我国当前经济安全发展的现实需求，建议采取如下措施来保护我国企业商业秘密：第一，制定并实施《统一商业秘密法》。在立法中扩大商业秘密保护范围，完善侵权认定、举证责任分配规则。第二，完善数据安全相关立法。在大数据与云环境下商业秘密作为一种数据，首先要是安全的。第三，构建数据删除权利保障制度。大数据时代，要保障数据安全，通过立法构建数据删除权的必要性日益凸显。第四，建立完善政府监管机制——云计算评估与监控中心加政府监管的监管机制。政府要对云服务进行监管，需要委托一个中立的第三方审计机构对云服务的各项技术指标、程序规范进行审计，然后再通过专门机构实施行政权力监管。