目的应用测序联合多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)技术对一个先天性无虹膜症家系进行分子遗传诊断。方法对参加研究的一个先天性无虹膜症家系的3个患者、1个非患者及3个无血缘关系的正常对照志愿者进行全面眼部检查,明确诊断,并收集患者临床资料。所有研究参与者均抽取静脉全血提取基因组DNA。将先证者进行PAX6基因外显子测序,测序的范围包括外显子及外显子与内含子交界处。将2个患者、1个非患者家系成员及3个无血缘关系的正常对照者采用SALSA MLPA P219PAX6probemix试剂盒对PAX6基因及其附近染色体区域进行MLPA。结果ANC先天性无虹膜症家系发病眼除虹膜部分或全部缺失外,合并眼球水平震颤,间歇性外斜视,角膜内皮细胞明显减少、失去六边形形态,晶状体混浊,黄斑中心凹发光消失、厚度变薄,视功能严重受损。先证者PAX6基因外显子及外显子与内含子交界处未发现基因突变。2个患者在PAX6基因1号内含子至5号外显子发现染色体片段杂合缺失,而非患者家系成员未发现该杂合缺失。该杂合缺失可能导致了翻译起始密码子的丢失,进而导致PAX6蛋白单倍体剂量不足,从而导致先天性无虹膜症。结论ANC先天性无虹膜症家系发病眼除虹膜部分或全部缺失外,常合并角膜、晶状体及黄斑病变,视功能严重受损。PAX6基因5’端染色体片段杂合缺失可能导致该家系的先天性无虹膜症,该杂合缺失目前尚未见报道。