农村金融体系与一国农业生产和农村经济发展紧密相连,各国在本国金融制度变迁过程中尤为重视农村金融体系的建设,纷纷在政府扶持下建立商业银行、政策性银行、合作金融组织和农业保险公司等共同参与的多层次、高效率的农村金融市场。在政府主导型强制性制度变迁的背景下,我国农村金融制度变迁同样离不开政府行为的影响。不管是恢复中国农业银行、深化农村信用社的产权制度改革,还是推行小额贷款公司和村镇银行试点,均由政府主导并推动。农村金融制度变迁中的政府行为能够降低变迁成本和达到预期制度安排所需时间,但从我国实际情况来看,政府行为还导致农村金融体系出现金融服务供求失衡、合作制异化等问题,并对整体制度效率产生不利影响。我们在政府行为对农村金融制度变迁及制度效率影响问题上首先从理论出发,借鉴新制度经济学制度变迁相关理论对我国农村金融市场现状进行分析。在理论分析基础上,我们以山东省农村信用社为例,运用比较分析、数据包络分析等实证方法检验政府行为对我国农村金融制度效率的影响情况。实证分析表明,政府行为确实能够对制度效率产生一定影响,但影响范围有限,农村金融制度效率的提高需要农村信用社等农村金融机构从自身出发,提高经营管理水平和服务“三农”能力。最后,我们在实证分析基础上提出有关完善农村金融体系、提高农村金融制度效率的政策建议。