自1988年起，我国积极推动高新技术产业发展，在全国先后建立53个国家级高新技术产业开发区，大力发展高新技术产业日益成为提高国家竞争优势的重要手段，及经济欠发达地区发挥后发的资源优势，实现经济跨越式发展的重要途径。新疆高新技术产业经过几十年的发展取得了长足的进步，到2011年新疆注册高新技术企业145余家，产业增加值达125.4亿元，从业人员7.35万人，研发经费投入达35.65亿元，企业类型涉及电子信息技术、高技术服务业、生物与新医药、新材料技术、资源与环境技术、新能源与节能技术以及高技术改造传统产业等多个行业，成为新疆经济发展重要增长点。　　 面临19省市援疆行动的开展、国家主体功能区规划的进一步推进，新疆科技支撑计划提出将高新技术产业培育成区域先导性支柱性产业的发展思路和天山北坡高新技术产业带的初步构建等一系列机遇，新疆高新技术产业发展迎来了新的发展阶段，如何进行合理产业布局，有效促进高新技术产业对落后地区经济的带动作用是一个值得研究的课题。本文基于问卷调查和统计数据，首先从产业规模、产业结构、产业布局和产业效率对新疆高新技术产业的发展现状进行了梳理，并利用灰色关联分析和投入产出分析法探索了高新技术产业与国民经济的互动关系;随后进一步通过产业宏观和企业微观角度，运用DEA（数据包络分析）探索了新疆高新技术产业的经济效率，最后探索新疆高新技术产业布局驱动因素，通过驱动因素分析，运用ARCGIS相关空间分析并进一步探索了新疆高新技术产业的未来布局路径。研究结果表明:(1)近10年间新疆高新技术产业企业数量增多、企业规模不断壮大、科技研发力度不断增强，就业人员素质全面提高，产业规模效益显现，产业结构不断优化，新疆高新技术产业发展与地区国民经济的互动作用显著。(2)新疆高新技术产业经济效率水平相对较低，远低于全国、东、中、西部地区平均水平，在全国31个省市中和西部地区，其经济效率均排在倒数第二位;内部高新技术企业的经济效率水平较低，平均经济效率为0.501，95％以上的企业生产相对无效状态，即大量投入获取较少的经济效益。(3)新疆高新技术企业布局呈现大分散、小聚集的分布格局，以乌鲁木齐、克拉玛依为主要区域，以天山北坡经济带、区域中心城市与产业园区为载体进行发展布局;企业调查显示，政府政策、区域市场条件，自然资源组合丰度是绝大多数企业企业选择的首选因素;区域政府政策水平、市场条件和人力资源水平是驱动新疆高新技术企业布局的主要因素;高新技术企业现在分布与区域政府政策水平、市场条件和人力资源水平呈现基本吻合格局。(4)新疆高新技术产业适宜度优势区域呈现出集中于天山北坡经济带，伴随城镇体系、经济格局和交通条件、物流水平协调分布的特点。天山北坡经济带、天山南坡石化产业带和新疆沿边经济带是未来高新技术产业适宜布局的主要区域，建议依托乌鲁木齐经济圈、天山北坡经济带和天山南坡石化产业带，构建“一圈、两带、沿边”的高新技术产业发展体系。